More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12180 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_12180  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
519 aa  1056    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1732  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.73 
 
 
480 aa  455  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.709367  hitchhiker  0.00631476 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06250  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  45.11 
 
 
456 aa  376  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0960619  hitchhiker  0.006008 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.44 
 
 
449 aa  279  7e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.61 
 
 
458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.32 
 
 
458 aa  233  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.84 
 
 
453 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.62 
 
 
448 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.62 
 
 
446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  34.65 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.23 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.08 
 
 
452 aa  212  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.14 
 
 
451 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.14 
 
 
452 aa  212  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.08 
 
 
452 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.08 
 
 
452 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.08 
 
 
452 aa  211  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.08 
 
 
452 aa  211  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.08 
 
 
452 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.88 
 
 
452 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.88 
 
 
452 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2527  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.4 
 
 
440 aa  209  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.258922  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.76 
 
 
501 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.24 
 
 
542 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.03 
 
 
443 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.24 
 
 
542 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1915  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.4 
 
 
471 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2804  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.29 
 
 
469 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345975  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.67 
 
 
452 aa  207  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.49 
 
 
447 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.03 
 
 
474 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.54 
 
 
443 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.32 
 
 
451 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.16 
 
 
443 aa  203  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.05 
 
 
460 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.97 
 
 
467 aa  203  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.83 
 
 
455 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2398  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.43 
 
 
467 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.58 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.72 
 
 
476 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.39 
 
 
460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3573  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.84 
 
 
445 aa  200  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.168579  hitchhiker  0.00774159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.4 
 
 
456 aa  200  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.4 
 
 
456 aa  200  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.58 
 
 
463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.73 
 
 
469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  32.24 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.11 
 
 
443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.48 
 
 
459 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.5 
 
 
393 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.47 
 
 
446 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.91 
 
 
454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.83 
 
 
460 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.94 
 
 
453 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.48 
 
 
436 aa  196  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.75 
 
 
449 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.99 
 
 
456 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.93 
 
 
459 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.62 
 
 
460 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.79 
 
 
456 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.79 
 
 
456 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0596  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.82 
 
 
448 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000355871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  30.79 
 
 
456 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.23 
 
 
458 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.53 
 
 
449 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.12 
 
 
460 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.12 
 
 
460 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.53 
 
 
449 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.53 
 
 
449 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2568  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.19 
 
 
460 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0973694  normal  0.16842 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1719  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.07 
 
 
454 aa  192  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.623668  hitchhiker  0.0000296907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.71 
 
 
459 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.53 
 
 
449 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.71 
 
 
463 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.57 
 
 
445 aa  192  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.6 
 
 
455 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.9 
 
 
448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.63 
 
 
393 aa  191  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.18 
 
 
457 aa  191  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.54 
 
 
511 aa  190  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.9 
 
 
448 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.41 
 
 
402 aa  190  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1415  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.19 
 
 
494 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0998332  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.56 
 
 
407 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.9 
 
 
448 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.04 
 
 
398 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2946  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.02 
 
 
436 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.877345 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.29 
 
 
407 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.18 
 
 
436 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.69 
 
 
450 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.14 
 
 
561 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.64 
 
 
458 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.89 
 
 
407 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.02 
 
 
458 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1132  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.44 
 
 
483 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692394  normal  0.0141184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 
443 aa  187  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.19 
 
 
496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.59 
 
 
406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.85 
 
 
414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.17 
 
 
445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>