More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2214 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2214  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
327 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0519028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2237  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
327 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2369  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  68.23 
 
 
325 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4366  Monosaccharide-transporting ATPase  44.65 
 
 
323 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  35.97 
 
 
345 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  37.29 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.64 
 
 
323 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40.14 
 
 
333 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  39.73 
 
 
310 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.73 
 
 
310 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  41.16 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 
835 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.14 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  37.69 
 
 
337 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  41.83 
 
 
334 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  38.08 
 
 
337 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  38.39 
 
 
340 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.92 
 
 
341 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  37.92 
 
 
372 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  41.97 
 
 
343 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  37.85 
 
 
347 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  37.85 
 
 
347 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  37.58 
 
 
306 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  38.41 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  38.13 
 
 
342 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  36.9 
 
 
405 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  38.13 
 
 
342 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.33 
 
 
358 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  38.13 
 
 
342 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  36.9 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  36.9 
 
 
405 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  40.67 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  40.67 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
311 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.71 
 
 
311 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 
311 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.71 
 
 
311 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2928  monosaccharide-transporting ATPase  45.75 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110864  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 
357 aa  139  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
311 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
311 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
311 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
311 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.91 
 
 
324 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 
318 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  33.86 
 
 
330 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  42.19 
 
 
343 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  37.92 
 
 
372 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.37 
 
 
311 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  33.86 
 
 
330 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  34.5 
 
 
356 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 
350 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 
330 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.03 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.03 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.8 
 
 
334 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.42 
 
 
332 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  37.94 
 
 
341 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.8 
 
 
334 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  35.42 
 
 
339 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  37.59 
 
 
354 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
332 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  38.11 
 
 
340 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.5 
 
 
334 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  34 
 
 
326 aa  135  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4659  monosaccharide-transporting ATPase  33.84 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  36 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  37.23 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  37.92 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  37.92 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  37.92 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  37.92 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.3 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  36.12 
 
 
340 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3311  monosaccharide-transporting ATPase  37.88 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  38.81 
 
 
345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  38.43 
 
 
345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  38.81 
 
 
345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  39.01 
 
 
335 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  38.81 
 
 
345 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.43 
 
 
334 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  34.17 
 
 
338 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  38.06 
 
 
322 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  39.01 
 
 
335 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  38.43 
 
 
345 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.82 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.18 
 
 
345 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.64 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  34.45 
 
 
351 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  35.82 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.91 
 
 
380 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.96 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  39.55 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  40.15 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.6 
 
 
358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>