More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0912 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0912  carbamoyl phosphate synthase small subunit  100 
 
 		 447 aa  914    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203932  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3032  carbamoyl phosphate synthase small subunit  66.38 
 
 		 467 aa  597  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.11486  normal  0.0418192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2885  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  64.6 
 
 		 389 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0435  carbamoyl phosphate synthase small subunit  61.68 
 
 		 392 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2871  carbamoyl phosphate synthase small subunit  62.77 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3986  carbamoyl phosphate synthase small subunit  62.7 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2446  carbamoyl phosphate synthase small subunit  61.97 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.505949  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1470  carbamoyl phosphate synthase small subunit  61.9 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4142  carbamoyl phosphate synthase small subunit  61.64 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6791  carbamoyl phosphate synthase small subunit  61.38 
 
 		 398 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0374748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2387  carbamoyl phosphate synthase small subunit  62.26 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0953377  normal  0.858607 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2294  carbamoyl phosphate synthase small subunit  61.52 
 
 		 386 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1246  carbamoyl phosphate synthase small subunit  61.41 
 
 		 384 aa  460  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2314  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  59.74 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0960  carbamoyl phosphate synthase small subunit  59.74 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0203745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1243  carbamoyl phosphate synthase small subunit  60.64 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0524  carbamoyl phosphate synthase small subunit  60.95 
 
 		 387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0661  carbamoyl phosphate synthase small subunit  60.53 
 
 		 387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.693727  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2165  carbamoyl phosphate synthase small subunit  60.32 
 
 		 382 aa  448  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1483  carbamoyl phosphate synthase small subunit  58.51 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1622  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  58.73 
 
 		 398 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0014107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1683  carbamoyl phosphate synthase small subunit  57.52 
 
 		 407 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2083  carbamoyl phosphate synthase small subunit  58.78 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1874  carbamoyl phosphate synthase small subunit  59.37 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.330959  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1439  carbamoyl phosphate synthase small subunit  58.24 
 
 		 407 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2706  carbamoyl phosphate synthase small subunit  57.51 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2965  carbamoyl phosphate synthase small subunit  57.25 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1037  carbamoyl phosphate synthase small subunit  56.58 
 
 		 388 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4526  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  59.89 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3210  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  59.74 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3111  carbamoyl phosphate synthase small subunit  57.51 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0983  carbamoyl phosphate synthase small subunit  55.26 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2229  carbamoyl phosphate synthase small subunit  57.26 
 
 		 401 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2231  carbamoyl phosphate synthase small subunit  57.92 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.961008  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0972  carbamoyl phosphate synthase small subunit  56.87 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0520373  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0626  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  57.82 
 
 		 416 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0570  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  57.78 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.308304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0591  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  58.36 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0615  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  57.82 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.156891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3531  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  56.43 
 
 		 421 aa  411  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3019  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  51.07 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3086  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  55.64 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0580438  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3359  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  52.55 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1613  carbamoyl phosphate synthase small subunit  52.14 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0266912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2036  carbamoyl phosphate synthase small subunit  52.24 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.534876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4432  carbamoyl phosphate synthase small subunit  52.24 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1728  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.98 
 
 		 378 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590257  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1261  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.72 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0131767  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  52.28 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0478  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.79 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2679  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.66 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4932  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.46 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0809  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.72 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1475  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.72 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1290  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.72 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0948613  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02244  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  51.6 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0231375  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1853  carbamoyl phosphate synthase small subunit  55.11 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0936768  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0834  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.37 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0896746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0770  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.45 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0032  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0938  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  52.39 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.742428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0564  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.45 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1811  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.82 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0542874 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0392  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.45 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.166847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1281  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.45 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.697849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1774  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.27 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0283036 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2783  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259596  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0451  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.72 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.758109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2729  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  53.35 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1256  carbamoyl phosphate synthase small subunit  53.03 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2215  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.59 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000311671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1505  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.45 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0587  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.45 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368687  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00036  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3567  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.19 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0591  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.66 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0072  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.955538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3621  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.31 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1127  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  52.83 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.390679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1608  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 381 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1858  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.33 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1731  carbamoyl phosphate synthase small subunit  53.08 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00035  hypothetical protein  51.19 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0036  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2195  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.92 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.137113 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0873  carbamoyl phosphate synthase small subunit  52.24 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.264285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2610  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.06 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2868  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.98 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00228162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00088  carbamoyl phosphate synthase small subunit  53.35 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0033  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3623  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2030  carbamoyl phosphate synthase small subunit  52.24 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0070  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.19 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1771  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.67 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0224697  normal  0.089739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62930  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.44 
 
 		 378 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1519  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.53 
 
 		 378 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2177  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.53 
 
 		 378 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1982  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  52.67 
 
 		 386 aa  363  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.157941  normal  0.0125598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>