7377 genes were found for organism Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 74    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Franean1_0001  CDS  NC_009921  71  1654  +  1584  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001504376  normal  1  normal  0.501183  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0002  CDS  NC_009921  2937  3959  +  1023  hypothetical protein  YP_001504377  normal  1  normal  0.284088  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0003  CDS  NC_009921  3956  5116  +  1161  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001504378  normal  1  normal  0.301808  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0004  CDS  NC_009921  5118  6491  +  1374  DNA replication and repair protein RecF  YP_001504379  normal  1  normal  0.470302  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0005  CDS  NC_009921  6712  7245  +  534  hypothetical protein  YP_001504380  normal  1  normal  0.40327  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0006  CDS  NC_009921  7555  9513  +  1959  DNA gyrase subunit B  YP_001504381  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0007  CDS  NC_009921  9711  12224  +  2514  DNA gyrase subunit A  YP_001504382  normal  1  normal  0.822047  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0008  CDS  NC_009921  12333  14270  +  1938  hypothetical protein  YP_001504383  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0009  CDS  NC_009921  15245  15862  +  618  hypothetical protein  YP_001504384  normal  0.198242  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0010  CDS  NC_009921  15821  17065  -  1245  hypothetical protein  YP_001504385  normal  0.225832  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0011  CDS  NC_009921  17052  17921  -  870  methyltransferase type 11  YP_001504386  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0012  CDS  NC_009921  17915  19291  -  1377  glycosyl transferase group 1  YP_001504387  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0013  CDS  NC_009921  19531  19959  -  429  OsmC family protein  YP_001504388  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0014  CDS  NC_009921  20169  20873  +  705  TetR family transcriptional regulator  YP_001504389  normal  0.730336  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0015  CDS  NC_009921  20881  21498  -  618  endopeptidase Clp  YP_001504390  normal  0.632715  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0016  CDS  NC_009921  21745  22848  -  1104  secretory lipase  YP_001504391  normal  0.118927  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0017  CDS  NC_009921  23241  24332  +  1092  SNARE associated Golgi protein  YP_001504392  normal  0.447324  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0018  CDS  NC_009921  24683  25021  -  339  nitrogen regulatory protein P-II  YP_001504393  normal  0.825328  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0019  CDS  NC_009921  25136  25678  +  543  PEBP family protein  YP_001504394  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0020  CDS  NC_009921  25853  26017  +  165  hypothetical protein  YP_001504395  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0021  CDS  NC_009921  26159  26716  -  558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001504396  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0022  CDS  NC_009921  26953  28206  -  1254  extracellular solute-binding protein  YP_001504397  normal  0.68503  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0023  CDS  NC_009921  28203  29546  -  1344  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  YP_001504398  normal  0.222017  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0024  CDS  NC_009921  29898  30662  +  765  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  YP_001504399  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0025  CDS  NC_009921  30889  31950  +  1062  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001504400  normal  0.599931  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0026    NC_009921  33926  35488  -  1563      normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0027  CDS  NC_009921  35609  36013  -  405  hypothetical protein  YP_001504401  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0028  CDS  NC_009921  36044  36967  -  924  hypothetical protein  YP_001504402  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0029  CDS  NC_009921  37290  37865  +  576  hypothetical protein  YP_001504403  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0030  CDS  NC_009921  37862  38839  +  978  hypothetical protein  YP_001504404  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0031  CDS  NC_009921  39584  40471  -  888  hypothetical protein  YP_001504405  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0032  CDS  NC_009921  40475  41677  -  1203  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  YP_001504406  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0033  CDS  NC_009921  42120  42485  -  366  hypothetical protein  YP_001504407  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0034  CDS  NC_009921  42461  43171  -  711  hypothetical protein  YP_001504408  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0035  CDS  NC_009921  43221  43496  -  276  hypothetical protein  YP_001504409  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0036  CDS  NC_009921  43699  44568  +  870  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001504410  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0037  CDS  NC_009921  44565  44774  +  210  hypothetical protein  YP_001504411  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0038  CDS  NC_009921  45693  46814  +  1122  integrase family protein  YP_001504412  normal  0.967515  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0039  CDS  NC_009921  46811  47149  +  339  XRE family transcriptional regulator  YP_001504413  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0040  CDS  NC_009921  47146  48660  +  1515  hypothetical protein  YP_001504414  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0041  CDS  NC_009921  48701  49600  -  900  aminoglycoside phosphotransferase  YP_001504415  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0042  CDS  NC_009921  49995  50705  +  711  resolvase domain-containing protein  YP_001504416  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0043  CDS  NC_009921  51034  56460  +  5427  hypothetical protein  YP_001504417  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0044  CDS  NC_009921  56470  56763  +  294  hypothetical protein  YP_001504418  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0045  CDS  NC_009921  56774  60883  +  4110  hypothetical protein  YP_001504419  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0046  CDS  NC_009921  61226  61570  -  345  hypothetical protein  YP_001504420  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0047  CDS  NC_009921  61583  61909  -  327  hypothetical protein  YP_001504421  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0048  CDS  NC_009921  61929  62132  +  204  hypothetical protein  YP_001504422  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0049  CDS  NC_009921  62283  63137  -  855  hypothetical protein  YP_001504423  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0050  CDS  NC_009921  63167  63649  -  483  hypothetical protein  YP_001504424  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0051  CDS  NC_009921  63682  65379  +  1698  hypothetical protein  YP_001504425  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0052  CDS  NC_009921  65379  66158  +  780  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001504426  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0053  CDS  NC_009921  66165  67283  -  1119  hypothetical protein  YP_001504427  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0054  CDS  NC_009921  67290  68258  -  969  putative O-methyltransferase  YP_001504428  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0055  CDS  NC_009921  68240  69427  -  1188  lanthionine synthetase C family protein  YP_001504429  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0056  CDS  NC_009921  69424  72531  -  3108  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  YP_001504430  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0057  CDS  NC_009921  72610  72801  -  192  hypothetical protein  YP_001504431  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0058  CDS  NC_009921  72866  74167  -  1302  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  YP_001504432  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0059  CDS  NC_009921  74912  76456  +  1545  serine/threonine protein kinase  YP_001504433  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0060  CDS  NC_009921  76584  76895  -  312  hypothetical protein  YP_001504434  normal  0.998038  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0061  CDS  NC_009921  76974  77804  +  831  hypothetical protein  YP_001504435  normal  0.586693  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0062  CDS  NC_009921  77817  79001  +  1185  hypothetical protein  YP_001504436  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0063    NC_009921  79376  80018  -  643      normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0064  CDS  NC_009921  80009  80491  -  483  hypothetical protein  YP_001504437  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0065  CDS  NC_009921  80561  80929  +  369  hypothetical protein  YP_001504438  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0066  CDS  NC_009921  81495  82970  -  1476  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_001504439  normal  0.592117  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0067  CDS  NC_009921  82991  83287  -  297  hypothetical protein  YP_001504440  normal  0.772735  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0068  CDS  NC_009921  83438  83728  -  291  hypothetical protein  YP_001504441  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0069  CDS  NC_009921  83908  84387  +  480  hypothetical protein  YP_001504442  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0070  CDS  NC_009921  84437  85057  -  621  IS630 family transposase  YP_001504443  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0071  CDS  NC_009921  84982  85521  -  540  IS630 family transposase  YP_001504444  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0072  CDS  NC_009921  86789  89791  +  3003  LuxR family transcriptional regulator  YP_001504445  normal  0.996458  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0073  CDS  NC_009921  90092  91351  +  1260  glycosyl transferase family protein  YP_001504446  normal  0.657142  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0074  CDS  NC_009921  91442  92632  +  1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001504447  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0075  CDS  NC_009921  92648  93160  +  513  hypothetical protein  YP_001504448  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0076  CDS  NC_009921  93263  93886  +  624  hypothetical protein  YP_001504449  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0077  CDS  NC_009921  94301  95116  -  816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001504450  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0078  CDS  NC_009921  95113  95979  -  867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001504451  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0079  CDS  NC_009921  96103  96657  +  555  PadR-like family transcriptional regulator  YP_001504452  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0080  CDS  NC_009921  97102  97470  -  369  hypothetical protein  YP_001504453  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0081  CDS  NC_009921  97795  99000  -  1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001504454  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0082  CDS  NC_009921  98997  99656  -  660  two component transcriptional regulator  YP_001504455  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0083  CDS  NC_009921  99828  100331  +  504  hypothetical protein  YP_001504456  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0084  CDS  NC_009921  100328  101554  +  1227  peptidoglycan binding domain-containing protein  YP_001504457  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0085  CDS  NC_009921  101551  102258  +  708  ABC transporter related  YP_001504458  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0086  CDS  NC_009921  102255  103571  +  1317  hypothetical protein  YP_001504459  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0087  CDS  NC_009921  103928  104269  +  342  hypothetical protein  YP_001504460  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0088  CDS  NC_009921  104451  105926  -  1476  aldo/keto reductase  YP_001504461  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0089  CDS  NC_009921  106070  106681  +  612  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001504462  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0090  CDS  NC_009921  106678  107595  +  918  hypothetical protein  YP_001504463  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0091  CDS  NC_009921  107696  108688  -  993  alcohol dehydrogenase  YP_001504464  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0092  CDS  NC_009921  108808  109800  -  993  GntR family transcriptional regulator  YP_001504465  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0093  CDS  NC_009921  110033  110944  +  912  alpha/beta hydrolase fold  YP_001504466  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0094  CDS  NC_009921  111434  112696  +  1263  amidohydrolase 2  YP_001504467  normal  0.986217  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0095  CDS  NC_009921  112875  113852  -  978  alcohol dehydrogenase  YP_001504468  normal  0.613109  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0096  CDS  NC_009921  113892  114695  -  804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_001504469  normal  0.839992  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0097  CDS  NC_009921  114692  115714  -  1023  aminoglycoside phosphotransferase  YP_001504470  normal  0.92974  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0098  CDS  NC_009921  115711  117012  -  1302  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001504471  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0099  CDS  NC_009921  117226  118992  -  1767  diguanylate cyclase  YP_001504472  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Franean1_0100  CDS  NC_009921  119081  119740  -  660  TetR family transcriptional regulator  YP_001504473  normal  1  normal  1  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 74    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>