18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0030 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  54.3 
 
 
329 aa  293  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  44.44 
 
 
343 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  36.81 
 
 
337 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  37.69 
 
 
337 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  35.09 
 
 
345 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  38.32 
 
 
343 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  38.19 
 
 
342 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  42.13 
 
 
338 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  35.98 
 
 
292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  37.89 
 
 
306 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  35.78 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  38.08 
 
 
302 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  31.84 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  32 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  37.97 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  31.54 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2057  hypothetical protein  37.32 
 
 
177 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>