20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1143 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  50.2 
 
 
294 aa  228  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  59.47 
 
 
209 aa  201  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  40.23 
 
 
329 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2057  hypothetical protein  60.14 
 
 
177 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  38.02 
 
 
343 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  35.77 
 
 
345 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  36.14 
 
 
292 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  37.01 
 
 
337 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  36.86 
 
 
337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  34.5 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  35.06 
 
 
343 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  38.08 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  34.65 
 
 
342 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  33.61 
 
 
274 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  34.31 
 
 
332 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1141  hypothetical protein  81.82 
 
 
106 aa  89  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  32.17 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  29.17 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7331  hypothetical protein  25.53 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00188546  hitchhiker  0.0000000179326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>