18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1788 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  75.07 
 
 		 345 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  70.25 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  56.97 
 
 		 337 aa  348  8e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  58.33 
 
 		 337 aa  345  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  54.71 
 
 		 338 aa  319  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  39.05 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  45.04 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  36.13 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  32.97 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  37.45 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  36.36 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  36.11 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  30.94 
 
 		 274 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  34.65 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  30.65 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  34.25 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0907  hypothetical protein  30.58 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>