20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2715 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  75.07 
 
 		 343 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  72.34 
 
 		 342 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  59.24 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  58.94 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  58.6 
 
 		 338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  47.41 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  39.63 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  34.32 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  38.49 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  36.36 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  34.5 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  35.77 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  32.54 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  38.3 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  34.92 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  31.35 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0907  hypothetical protein  29.63 
 
 		 269 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2057  hypothetical protein  35.34 
 
 		 177 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7331  hypothetical protein  27.03 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00188546  hitchhiker  0.0000000179326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>