19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4078 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  43.75 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  44.2 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  43.58 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  43.11 
 
 		 345 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  42.72 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  40.13 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  46.19 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  46.85 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  41.09 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  37.17 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  37.35 
 
 		 302 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  38.19 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  32.03 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  37.82 
 
 		 209 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  32.17 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2057  hypothetical protein  37.41 
 
 		 177 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7331  hypothetical protein  30.2 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00188546  hitchhiker  0.0000000179326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>