18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2057 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2057  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  356  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  60.14 
 
 
302 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  62.59 
 
 
209 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  50.71 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  35.88 
 
 
329 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1141  hypothetical protein  64.15 
 
 
106 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  36.05 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  36.09 
 
 
306 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  37.21 
 
 
343 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  38.03 
 
 
325 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  35.34 
 
 
345 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  31.08 
 
 
337 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  30 
 
 
337 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  31.06 
 
 
332 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  29.85 
 
 
338 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  30.4 
 
 
342 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  31.21 
 
 
343 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  28.46 
 
 
274 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>