19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3664 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  59.9 
 
 
302 aa  202  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  47.34 
 
 
294 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2057  hypothetical protein  61.87 
 
 
177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  37.16 
 
 
338 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  33.86 
 
 
329 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  35.11 
 
 
337 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  38.36 
 
 
343 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  34.57 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  33.15 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  37.57 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  38 
 
 
342 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  34.92 
 
 
345 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  37.78 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  36.71 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1141  hypothetical protein  63.46 
 
 
106 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  36.07 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  26.78 
 
 
274 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  25.77 
 
 
305 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>