19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2550 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  91.1 
 
 		 337 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  68.25 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  58.94 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  62.98 
 
 		 342 aa  338  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  59.4 
 
 		 343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  45.72 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  40.36 
 
 		 329 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  37.7 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  36.61 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  38.49 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  33.96 
 
 		 294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  37.01 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  31.71 
 
 		 274 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  35.11 
 
 		 209 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  29.27 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2057  hypothetical protein  31.08 
 
 		 177 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7331  hypothetical protein  26.44 
 
 		 313 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00188546  hitchhiker  0.0000000179326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>