19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1985 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  50.2 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  47.34 
 
 		 209 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  39.85 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  36.8 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  36.36 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  34.58 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  33.96 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  33.68 
 
 		 337 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2057  hypothetical protein  50.71 
 
 		 177 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  36.75 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  36.7 
 
 		 342 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  35.78 
 
 		 325 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  34.23 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  32.05 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  33.62 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  30.69 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  29.6 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1141  hypothetical protein  66.67 
 
 		 106 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>