18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1695 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  662    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  91.1 
 
 
337 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  67.95 
 
 
338 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  59.24 
 
 
345 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  63.01 
 
 
342 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  60.21 
 
 
343 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  41.43 
 
 
329 aa  185  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  47.01 
 
 
343 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  37.1 
 
 
325 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  37.07 
 
 
292 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  38.96 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  33.68 
 
 
294 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  36.12 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  37.01 
 
 
302 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  33.45 
 
 
274 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  34.57 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  30.66 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2057  hypothetical protein  30 
 
 
177 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>