20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6730 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  52.56 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  44.36 
 
 
343 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  39.5 
 
 
337 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  38.24 
 
 
337 aa  185  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  39.63 
 
 
345 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  38.51 
 
 
338 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  41.45 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  39.64 
 
 
342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  40.71 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  35.41 
 
 
292 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  34.58 
 
 
294 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  34.98 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  33.95 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  33.86 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  33.04 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  30.7 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2057  hypothetical protein  35.88 
 
 
177 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7331  hypothetical protein  28.29 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00188546  hitchhiker  0.0000000179326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0907  hypothetical protein  28.09 
 
 
269 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>