17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4420 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  630  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  30.63 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  29.96 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  26.69 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  29.65 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  30.66 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  29.6 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  30.8 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  30.7 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  29.27 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  30.54 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  28.79 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  31.35 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  30.89 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  28.21 
 
 
332 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  28.44 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  24.61 
 
 
209 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0187767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>