18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2746 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  68.25 
 
 
337 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  67.95 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  58.6 
 
 
345 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  58.66 
 
 
342 aa  339  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  57.52 
 
 
343 aa  322  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  40.36 
 
 
329 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  45.3 
 
 
343 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  38.71 
 
 
325 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  35.5 
 
 
306 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  34.8 
 
 
292 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  38.08 
 
 
332 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  34.88 
 
 
302 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  34.15 
 
 
294 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  31.75 
 
 
274 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  37.16 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  29.1 
 
 
305 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7331  hypothetical protein  28.12 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00188546  hitchhiker  0.0000000179326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>