13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7331 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7331  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  630  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00188546  hitchhiker  0.0000000179326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1435  hypothetical protein  36.12 
 
 
330 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0798469  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0907  hypothetical protein  37.59 
 
 
269 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2067  hypothetical protein  32.38 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102291  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4633  hypothetical protein  30.52 
 
 
256 aa  79  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  28.29 
 
 
329 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  27.86 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  28.12 
 
 
338 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  27.03 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  25.74 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  29.29 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  26.44 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5233  hypothetical protein  26.22 
 
 
325 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0996633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>