18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2778 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  72.22 
 
 		 345 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  70.25 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  60.19 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  59.87 
 
 		 337 aa  358  7e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  58.63 
 
 		 338 aa  339  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  39.64 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  45.69 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  36.25 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  38.34 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  36.7 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  33.73 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  34.65 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  32.34 
 
 		 274 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  34 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  31.54 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  38 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7331  hypothetical protein  27.86 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00188546  hitchhiker  0.0000000179326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>