83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0016 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  100 
 
 
367 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  58.64 
 
 
442 aa  341  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  35.75 
 
 
417 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  33.77 
 
 
420 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  34.17 
 
 
406 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  32.42 
 
 
444 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  33.33 
 
 
346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  31.71 
 
 
415 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  33.61 
 
 
385 aa  126  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  30.9 
 
 
413 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  28.86 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  30.19 
 
 
392 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  28.06 
 
 
432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  32.92 
 
 
376 aa  113  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  32.23 
 
 
433 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  32.23 
 
 
433 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  32.23 
 
 
433 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  28.68 
 
 
422 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  27.23 
 
 
434 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  29.81 
 
 
427 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  29.81 
 
 
427 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  27.03 
 
 
410 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  27.03 
 
 
410 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  27.03 
 
 
410 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  28.69 
 
 
417 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  30.91 
 
 
405 aa  92.8  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  29.03 
 
 
409 aa  92.8  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  29.26 
 
 
395 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  35 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  33.43 
 
 
451 aa  90.5  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  29.73 
 
 
427 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  30.27 
 
 
383 aa  86.3  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  27.03 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  27.03 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  27.03 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  27.89 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  28.96 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  28.77 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  28.7 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  29.07 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  28.69 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  28.69 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  27.89 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  27 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  24.29 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11608  hypothetical protein  25.97 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.166185  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  24.57 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01799  secretory lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00110)  24.78 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803381  normal  0.696532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  25.53 
 
 
464 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3130  triacylglycerol lipase  25.14 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.648254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3070  triacylglycerol lipase  25.14 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3087  triacylglycerol lipase  25.14 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0434  triacylglycerol lipase  25.44 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0424  triacylglycerol lipase  25.44 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0411  triacylglycerol lipase  25.44 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3621  triacylglycerol lipase  24.86 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120078  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2796  triacylglycerol lipase  26.32 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604768  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  36.8 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0814  secretory lipase  27.42 
 
 
444 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  24.47 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0186  Triacylglycerol lipase  23.73 
 
 
481 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5608  triacylglycerol lipase  25.06 
 
 
440 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5251  triacylglycerol lipase  25.06 
 
 
440 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  32.76 
 
 
465 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0048  Triacylglycerol lipase  27.23 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  26.3 
 
 
470 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4620  triacylglycerol lipase  24.81 
 
 
440 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0085  triacylglycerol lipase  24.12 
 
 
438 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  27.37 
 
 
398 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  27.75 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  30.29 
 
 
422 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28952  predicted protein  25.93 
 
 
482 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0716767  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  29 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  30.29 
 
 
422 aa  49.7  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0760  secretory lipase  25.51 
 
 
468 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  29.12 
 
 
424 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06773  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 
448 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355363  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1122  Triacylglycerol lipase  27.16 
 
 
444 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  31.76 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  28.57 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  26.85 
 
 
527 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2046  secretory lipase  30.99 
 
 
505 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  26.67 
 
 
404 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>