59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0264 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  100 
 
 
395 aa  775    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  56.93 
 
 
397 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  56.48 
 
 
399 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  56.48 
 
 
399 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  57.37 
 
 
382 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  54.97 
 
 
379 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  54.88 
 
 
397 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  54.55 
 
 
388 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  54.7 
 
 
366 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  40.81 
 
 
400 aa  203  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  35.62 
 
 
376 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  37.46 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  36.99 
 
 
427 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  36.44 
 
 
427 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  33.95 
 
 
386 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  35.33 
 
 
417 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  35.45 
 
 
410 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  35.45 
 
 
410 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  34.91 
 
 
376 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  35.21 
 
 
410 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  36.1 
 
 
407 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  34.19 
 
 
426 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  34.28 
 
 
377 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  34.28 
 
 
377 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  32.33 
 
 
375 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  31.92 
 
 
346 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  30.72 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  30.97 
 
 
417 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  30.4 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  24.94 
 
 
433 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  28.34 
 
 
444 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  31.07 
 
 
432 aa  93.6  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  32.63 
 
 
413 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  31.09 
 
 
415 aa  89.7  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  30.67 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  36.31 
 
 
406 aa  86.3  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  39.09 
 
 
451 aa  85.5  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  41.28 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  32.99 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  33.77 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  33.77 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  33.77 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  29.29 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  28.08 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  39.6 
 
 
201 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  30.19 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  30.47 
 
 
405 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  31.79 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  27.24 
 
 
422 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  30.46 
 
 
422 aa  60.1  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  29.66 
 
 
420 aa  56.6  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  29.14 
 
 
409 aa  56.6  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  32.19 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  32.19 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  30 
 
 
439 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  30.77 
 
 
527 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  32.94 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  24.84 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  26.11 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>