51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1355 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  98.11 
 
 
424 aa  855    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  868    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  60.71 
 
 
422 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  59.34 
 
 
420 aa  509  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  58.69 
 
 
422 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  59.81 
 
 
426 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  27.9 
 
 
528 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  26.61 
 
 
528 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  26.7 
 
 
527 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  27.38 
 
 
527 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  30.85 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  26.36 
 
 
398 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  26.16 
 
 
402 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  28.97 
 
 
465 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  24.86 
 
 
404 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  23.5 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  24.89 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  28.99 
 
 
376 aa  57  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  30.38 
 
 
417 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  32.12 
 
 
405 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  31.47 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  29.03 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  26.82 
 
 
366 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  32.45 
 
 
375 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  26.88 
 
 
404 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  34.38 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  29.86 
 
 
400 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  25.22 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  28.66 
 
 
420 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  25.71 
 
 
417 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  29.17 
 
 
415 aa  49.7  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  27.81 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  28.19 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  25.71 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  30.51 
 
 
383 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  25.23 
 
 
401 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  30.22 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  30.07 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  27.87 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  27.87 
 
 
377 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  27.87 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  27.87 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  27.87 
 
 
377 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  27.87 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  29.71 
 
 
406 aa  46.6  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  27.97 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  27.97 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  30.41 
 
 
388 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  26.49 
 
 
434 aa  43.5  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  26.54 
 
 
432 aa  43.1  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  27.27 
 
 
382 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>