64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1352 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  771    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  62.13 
 
 
366 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  60.05 
 
 
399 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  60.05 
 
 
399 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  60.53 
 
 
382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  61.96 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  59.02 
 
 
397 aa  431  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  54.37 
 
 
395 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  54.11 
 
 
397 aa  361  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  39.07 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  38.74 
 
 
427 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  37.28 
 
 
427 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  37.28 
 
 
427 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  37.96 
 
 
376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  37.22 
 
 
410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  36.94 
 
 
410 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  37.14 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  36.67 
 
 
410 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  38.04 
 
 
400 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  38.08 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  35.91 
 
 
426 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  35.61 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  35.61 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  34.24 
 
 
407 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  32.86 
 
 
346 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  33.15 
 
 
375 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  31.27 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  28.25 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  30.75 
 
 
420 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  31.23 
 
 
383 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  29.49 
 
 
444 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  28.15 
 
 
417 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  31.17 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  28.78 
 
 
415 aa  93.2  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  24.73 
 
 
433 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  28.93 
 
 
433 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  28.93 
 
 
433 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  28.93 
 
 
433 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  28.65 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  31.08 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  37.31 
 
 
451 aa  81.6  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  33.33 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  25.73 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  30.9 
 
 
201 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  28.68 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  25.45 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  27.89 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  31.3 
 
 
434 aa  63.5  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  31.21 
 
 
426 aa  59.7  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  34.62 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  29.93 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  31.65 
 
 
398 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  30.56 
 
 
422 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  28.4 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  27.95 
 
 
404 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  28.67 
 
 
527 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3014  acetyl esterase  46.3 
 
 
277 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  30.41 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  27.01 
 
 
420 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  30.41 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.21 
 
 
299 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11608  hypothetical protein  25.34 
 
 
446 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.166185  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  23.77 
 
 
470 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0814  secretory lipase  22.64 
 
 
444 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>