39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4125 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  80.3 
 
 		 528 aa  822    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  65.02 
 
 		 527 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1063    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  54.06 
 
 		 538 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  43.71 
 
 		 527 aa  362  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  31.86 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  29.15 
 
 		 422 aa  171  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  28.41 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  28.96 
 
 		 422 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  27.9 
 
 		 424 aa  151  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  27.25 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  29.88 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  28.63 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  28.42 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  28.81 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  25.27 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  33.1 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  28.57 
 
 		 465 aa  62  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  25 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  34.31 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  31.21 
 
 		 346 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  29.78 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  30.22 
 
 		 410 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  29.78 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  29.78 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  29.78 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  29.78 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  26.58 
 
 		 405 aa  54.3  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3719  hypothetical protein  28.99 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  28.84 
 
 		 385 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  28.9 
 
 		 417 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  26.72 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  29.17 
 
 		 417 aa  50.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  28.29 
 
 		 386 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  30.99 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  30.43 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  30.77 
 
 		 427 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  30.92 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  30.43 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0441069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>