64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0393 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  100 
 
 		 386 aa  793    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  76.6 
 
 		 376 aa  591  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  43.58 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  42.74 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  43.73 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  43.02 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  39.49 
 
 		 410 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  39.2 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  39.2 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  37.61 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  38.18 
 
 		 426 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  38.18 
 
 		 377 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  38.18 
 
 		 377 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  37.97 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  33.78 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  34.85 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  35.31 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  35.31 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  34.72 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  34.46 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  33.15 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  31.49 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  31.18 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  30.84 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  31.18 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  29.46 
 
 		 376 aa  116  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  26.87 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  37.5 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  28.21 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  28.99 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  37.5 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  42.37 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  28.27 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  25.36 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  32.05 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  34.13 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  25.34 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  27.99 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  37.7 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  26.63 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  29.09 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  25.15 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  27.22 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  35.37 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  36.09 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  31.82 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  35.54 
 
 		 433 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  35.82 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  35.54 
 
 		 433 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  35.54 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  29 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  28.35 
 
 		 424 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  29.45 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  29.75 
 
 		 464 aa  49.7  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  31.54 
 
 		 201 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  23.99 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  29.45 
 
 		 527 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  25.94 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.03 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  24.73 
 
 		 470 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  27.27 
 
 		 527 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  27.15 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  28.1 
 
 		 528 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01799  secretory lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00110)  28 
 
 		 450 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803381  normal  0.696532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>