30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5090 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1057    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  45.16 
 
 		 538 aa  395  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  45.09 
 
 		 528 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  42.74 
 
 		 528 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  42.83 
 
 		 527 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  28.2 
 
 		 426 aa  147  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  26.7 
 
 		 424 aa  140  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  26.45 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  27.63 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  26.97 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  26.8 
 
 		 420 aa  126  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  25.32 
 
 		 398 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  27.22 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  28.42 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  31.75 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  32.61 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  26.56 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  28.99 
 
 		 404 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  30.77 
 
 		 346 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  28.49 
 
 		 417 aa  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3040  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.84 
 
 		 678 aa  47.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.157189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  29.45 
 
 		 386 aa  47  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  27.91 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  32.28 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.77 
 
 		 719 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  28.48 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  25.85 
 
 		 401 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  31.18 
 
 		 465 aa  44.3  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  26.62 
 
 		 404 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  33.8 
 
 		 376 aa  43.5  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>