34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3255 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  75 
 
 		 401 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  74.33 
 
 		 412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3719  hypothetical protein  30.75 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  26.5 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  27.08 
 
 		 401 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  24.31 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  24.88 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  31.71 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  25 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  31.19 
 
 		 528 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  25.58 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  29.9 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  31.85 
 
 		 528 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  30.39 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  23.16 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  27.84 
 
 		 527 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  23.25 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  30.41 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  27.06 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  27.06 
 
 		 427 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  25.57 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  34.67 
 
 		 538 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  26.32 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  26.79 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  27.54 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  27.86 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  27.95 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  27.86 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  27.86 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  27.86 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  27.04 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  27.86 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  28.08 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>