32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0552 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  80.3 
 
 
528 aa  814    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  64.6 
 
 
527 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  1061    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  54.16 
 
 
538 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  45.69 
 
 
527 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  30.61 
 
 
426 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  27.78 
 
 
420 aa  159  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  27.85 
 
 
422 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  27.87 
 
 
424 aa  156  9e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  27.45 
 
 
424 aa  153  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  27.78 
 
 
422 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  28.3 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  24.06 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  28.22 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  29.61 
 
 
404 aa  63.9  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  31.97 
 
 
412 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  30.25 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  29.58 
 
 
404 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  31.85 
 
 
346 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3719  hypothetical protein  29.34 
 
 
461 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  30.46 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  31.97 
 
 
383 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  32.59 
 
 
426 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  32.59 
 
 
377 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  32.59 
 
 
377 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  32.59 
 
 
410 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  32.59 
 
 
410 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  32.59 
 
 
410 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  28.07 
 
 
385 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  31.06 
 
 
375 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  26.67 
 
 
444 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  30.26 
 
 
413 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>