74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0972 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  100 
 
 
375 aa  740    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  37.75 
 
 
346 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  34.05 
 
 
366 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  31.99 
 
 
407 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  34.43 
 
 
379 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  34.54 
 
 
376 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  35.54 
 
 
410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  35.28 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  35.82 
 
 
427 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  35.01 
 
 
410 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  35.05 
 
 
427 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  33.51 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  33.24 
 
 
388 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  36.13 
 
 
427 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  30.77 
 
 
417 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  35.67 
 
 
377 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  35.77 
 
 
426 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  35.67 
 
 
377 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  31.68 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  33.42 
 
 
397 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  34.42 
 
 
417 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  32.28 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  30.46 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  33.52 
 
 
399 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  33.52 
 
 
399 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  33.24 
 
 
382 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  35.87 
 
 
400 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  26.67 
 
 
376 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  39.32 
 
 
383 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  28.21 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  43.31 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  29.92 
 
 
406 aa  93.2  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  27.72 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  30.43 
 
 
409 aa  86.3  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  36.78 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  30.11 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  31.8 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  32.43 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  29.09 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  31.98 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  33.13 
 
 
426 aa  67  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  34.69 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  32.52 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  28.95 
 
 
422 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  32.87 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  30 
 
 
432 aa  64.7  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  33.94 
 
 
433 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  33.94 
 
 
433 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  33.94 
 
 
433 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  33.96 
 
 
439 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  37.5 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  34.21 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  28.69 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  32.56 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  33.56 
 
 
420 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  28.64 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  32.45 
 
 
424 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  32.45 
 
 
424 aa  53.9  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11608  hypothetical protein  34.21 
 
 
446 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.166185  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2796  triacylglycerol lipase  30.04 
 
 
450 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0424  triacylglycerol lipase  31.92 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3070  triacylglycerol lipase  32.99 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0434  triacylglycerol lipase  31.92 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3087  triacylglycerol lipase  32.99 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0411  triacylglycerol lipase  31.92 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3130  triacylglycerol lipase  32.99 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.648254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3621  triacylglycerol lipase  31.19 
 
 
450 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120078  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  26.95 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  34.03 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  31.06 
 
 
528 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  26.97 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  31.41 
 
 
527 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  28.67 
 
 
527 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  28.67 
 
 
404 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.217515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>