58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1917 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  100 
 
 
399 aa  784    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  98.95 
 
 
382 aa  747    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  100 
 
 
399 aa  784    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  68.58 
 
 
379 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  68.58 
 
 
366 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  61.75 
 
 
388 aa  434  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  58.86 
 
 
397 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  58.02 
 
 
395 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  55.68 
 
 
397 aa  359  5e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  37.8 
 
 
427 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  36.72 
 
 
410 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  36.72 
 
 
410 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  36.72 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  37.32 
 
 
427 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  37.56 
 
 
427 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  35.89 
 
 
417 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  38.98 
 
 
400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  34.25 
 
 
376 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  35.36 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  35.36 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  35.36 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  35.14 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  33.8 
 
 
386 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  35 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  34.2 
 
 
346 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  33.52 
 
 
375 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  30.65 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  28.53 
 
 
444 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  28.29 
 
 
417 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  28.69 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  26.55 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  31.67 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  31.89 
 
 
451 aa  89.4  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  29.63 
 
 
420 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  28.77 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  26.03 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  27.39 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  31.27 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  35.45 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  36.36 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  35.33 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  35.33 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  35.33 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  32.14 
 
 
426 aa  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  34.62 
 
 
439 aa  63.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  31.3 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  29.05 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  25.7 
 
 
422 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  29.45 
 
 
422 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  25.99 
 
 
470 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  36.94 
 
 
409 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  25.82 
 
 
367 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  27.63 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  28.8 
 
 
420 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  27.97 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  27.97 
 
 
424 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  23.98 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  27.75 
 
 
527 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>