37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2422 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  100 
 
 
201 aa  394  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  36.15 
 
 
379 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  35.45 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  35.45 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  35.45 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  34.96 
 
 
397 aa  71.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  31.13 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  37.12 
 
 
395 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  31.58 
 
 
400 aa  68.2  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  34.95 
 
 
366 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  31.63 
 
 
397 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  36.7 
 
 
427 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  35.77 
 
 
444 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  38.04 
 
 
385 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  38.3 
 
 
346 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  34.86 
 
 
427 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  37.21 
 
 
427 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  35 
 
 
417 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  31.41 
 
 
426 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  31.41 
 
 
410 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  31.41 
 
 
410 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  37.63 
 
 
451 aa  56.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  31.41 
 
 
410 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  31.41 
 
 
377 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  36.63 
 
 
415 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  31.41 
 
 
377 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  37.3 
 
 
392 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  36.99 
 
 
407 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  31.54 
 
 
386 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  34.41 
 
 
376 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  30.17 
 
 
442 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  32.26 
 
 
413 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  29.46 
 
 
417 aa  44.7  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  32.14 
 
 
376 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  32.65 
 
 
433 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  32.65 
 
 
433 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  32.65 
 
 
433 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>