56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0814 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0814  secretory lipase  100 
 
 
444 aa  908    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0424  triacylglycerol lipase  30.55 
 
 
447 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3621  triacylglycerol lipase  30.23 
 
 
450 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120078  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0411  triacylglycerol lipase  30.55 
 
 
447 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0434  triacylglycerol lipase  30.55 
 
 
447 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3070  triacylglycerol lipase  29.59 
 
 
450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3087  triacylglycerol lipase  29.59 
 
 
450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3130  triacylglycerol lipase  29.59 
 
 
450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.648254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2796  triacylglycerol lipase  29.57 
 
 
450 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604768  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11608  hypothetical protein  29.04 
 
 
446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.166185  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0048  Triacylglycerol lipase  28.07 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  26.3 
 
 
464 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  28.9 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0186  Triacylglycerol lipase  27.43 
 
 
481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01799  secretory lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00110)  29.33 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803381  normal  0.696532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  30.84 
 
 
415 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  25.68 
 
 
392 aa  93.6  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  29.11 
 
 
439 aa  91.3  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06773  conserved hypothetical protein  28.01 
 
 
448 aa  90.1  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355363  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0085  triacylglycerol lipase  28.47 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4620  triacylglycerol lipase  28.68 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  25.5 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5251  triacylglycerol lipase  28.68 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5608  triacylglycerol lipase  28.68 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  27.92 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  31.66 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  27.49 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0760  secretory lipase  26.42 
 
 
468 aa  73.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  27.27 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  27.27 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  27.27 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28952  predicted protein  24.31 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0716767  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  27.27 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1122  Triacylglycerol lipase  25.51 
 
 
444 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  24.05 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  25.31 
 
 
375 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  25.23 
 
 
470 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  24.31 
 
 
366 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  23.15 
 
 
432 aa  50.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  22.02 
 
 
420 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  23.21 
 
 
382 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2046  secretory lipase  25.62 
 
 
505 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  22.79 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  24.24 
 
 
376 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  22.79 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  23.74 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  24.14 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  24.05 
 
 
426 aa  47.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  23.92 
 
 
422 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  23.44 
 
 
427 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  25.48 
 
 
346 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  24.21 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  25.95 
 
 
442 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  26.61 
 
 
367 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  27.54 
 
 
417 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  23.51 
 
 
385 aa  43.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>