38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0008 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0008  hypothetical protein  100 
 
 
645 aa  1197    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0009  hypothetical protein  52.48 
 
 
228 aa  212  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0008  hypothetical protein  42.44 
 
 
252 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0008  hypothetical protein  44.62 
 
 
245 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0008  hypothetical protein  47.29 
 
 
230 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.327365  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00080  hypothetical protein  39.2 
 
 
275 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0008  hypothetical protein  47.58 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.252458 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0008  putative FHA domain containing protein  38.98 
 
 
331 aa  107  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0008  hypothetical protein  46.9 
 
 
288 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0008  hypothetical protein  45 
 
 
178 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.576466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10007  hypothetical protein  36.36 
 
 
304 aa  103  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0008  hypothetical protein  39.01 
 
 
290 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0016  hypothetical protein  39.01 
 
 
290 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403515  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0008  hypothetical protein  39.01 
 
 
290 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0746422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0820  hypothetical protein  36.57 
 
 
314 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12406  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0010  hypothetical protein  45.31 
 
 
308 aa  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.455486  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0009  hypothetical protein  42.28 
 
 
215 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994144  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0012  hypothetical protein  39.37 
 
 
237 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0008  hypothetical protein  46.27 
 
 
274 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0008  hypothetical protein  39.17 
 
 
305 aa  99.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0008  hypothetical protein  36.36 
 
 
301 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0009  hypothetical protein  44.53 
 
 
302 aa  99  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0007  hypothetical protein  38.46 
 
 
316 aa  97.4  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00080  hypothetical protein  43.1 
 
 
248 aa  95.5  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.852308  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0008  hypothetical protein  36.15 
 
 
135 aa  94  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0011  hypothetical protein  38.79 
 
 
232 aa  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0008  hypothetical protein  40.17 
 
 
171 aa  87.8  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00852528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0008  hypothetical protein  39.83 
 
 
215 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00070  hypothetical protein  34.62 
 
 
166 aa  82  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0008  putative integral membrane protein  39.67 
 
 
128 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000831576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0008  hypothetical protein  38.66 
 
 
238 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0007  hypothetical protein  36.81 
 
 
152 aa  75.1  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00120  hypothetical protein  33.56 
 
 
201 aa  73.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0008  hypothetical protein  39.29 
 
 
172 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1430  hypothetical protein  34.48 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0009  hypothetical protein  35.58 
 
 
107 aa  64.3  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00080  hypothetical protein  37.21 
 
 
162 aa  59.3  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0039  hypothetical protein  30.77 
 
 
221 aa  55.5  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>