38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0008 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0008  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.327365  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0008  hypothetical protein  54.79 
 
 
252 aa  197  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0008  hypothetical protein  48.55 
 
 
245 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0008  hypothetical protein  57.89 
 
 
274 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0009  hypothetical protein  54.88 
 
 
215 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994144  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0008  hypothetical protein  47.29 
 
 
645 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0008  hypothetical protein  50 
 
 
202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.252458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0008  hypothetical protein  43.33 
 
 
288 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00080  hypothetical protein  42.62 
 
 
248 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.852308  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0010  hypothetical protein  39.89 
 
 
308 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.455486  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0009  hypothetical protein  44.26 
 
 
228 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0009  hypothetical protein  43.75 
 
 
302 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0008  hypothetical protein  35.26 
 
 
290 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0746422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0008  hypothetical protein  35.26 
 
 
290 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0016  hypothetical protein  35.26 
 
 
290 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403515  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0007  hypothetical protein  38.13 
 
 
316 aa  98.6  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0012  hypothetical protein  39.1 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00070  hypothetical protein  35.12 
 
 
166 aa  92.8  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0008  hypothetical protein  32.75 
 
 
178 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.576466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0820  hypothetical protein  36.3 
 
 
314 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12406  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0007  hypothetical protein  38.36 
 
 
152 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0008  hypothetical protein  37.78 
 
 
301 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0008  hypothetical protein  35.59 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10007  hypothetical protein  32.94 
 
 
304 aa  89  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0008  putative FHA domain containing protein  33.87 
 
 
331 aa  89  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0011  hypothetical protein  34.88 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0008  putative integral membrane protein  38.28 
 
 
128 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000831576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00080  hypothetical protein  29.25 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0008  hypothetical protein  40.98 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00852528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0008  hypothetical protein  30.17 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0008  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  80.5  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0008  hypothetical protein  35.04 
 
 
172 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00120  hypothetical protein  33.73 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1430  hypothetical protein  34.17 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0008  hypothetical protein  34.43 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0039  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0009  hypothetical protein  32.73 
 
 
107 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00080  hypothetical protein  27.46 
 
 
162 aa  52.4  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>