5054 genes were found for organism Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CPS_0001  CDS  NC_003910  72  1457  +  1386  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_266783  normal  0.926832  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0002  CDS  NC_003910  1496  2599  +  1104  DNA polymerase III, beta subunit  YP_266784  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0003  CDS  NC_003910  2635  3768  +  1134  DNA replication and repair protein RecF  YP_266785  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0004  CDS  NC_003910  3778  6222  +  2445  DNA gyrase, B subunit  YP_266786  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0005  CDS  NC_003910  6388  7323  +  936  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_266787  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0006  CDS  NC_003910  7323  9389  +  2067  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_266788  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0007  CDS  NC_003910  9849  10163  +  315  hypothetical protein  YP_266789  normal  0.807913  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0008  CDS  NC_003910  10196  10447  +  252  hypothetical protein  YP_266790  normal  0.482211  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0009  CDS  NC_003910  10789  11481  -  693  signal peptidase I  YP_266791  normal  0.407191  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0010  CDS  NC_003910  11579  11824  -  246  sirA protein  YP_266792  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0011  CDS  NC_003910  11977  13908  +  1932  putative soluble lytic murein transglycosylase  YP_266793  normal  0.868574  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0012  CDS  NC_003910  13936  14118  -  183  hypothetical protein  YP_266794  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0013  CDS  NC_003910  14074  15405  +  1332  proline dipeptidase  YP_266795  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0014  CDS  NC_003910  15591  16217  +  627  hypothetical protein  YP_266796  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0015  CDS  NC_003910  16242  17693  +  1452  Trk system potassium uptake protein TrkH  YP_266797  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0016  CDS  NC_003910  17757  20696  -  2940  hypothetical protein  YP_266798  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0017  CDS  NC_003910  21059  22435  -  1377  potassium transporter peripheral membrane component  YP_266799  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0018  CDS  NC_003910  22465  23787  -  1323  sun protein  YP_266800  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0019  CDS  NC_003910  23796  24779  -  984  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_266801  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0020  CDS  NC_003910  24812  25327  -  516  polypeptide deformylase  YP_266802  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0021  CDS  NC_003910  25482  26567  +  1086  LysM domain-containing protein  YP_266803  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0022  CDS  NC_003910  26651  27802  +  1152  putative DNA processing protein DprA  YP_266804  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0023  CDS  NC_003910  27822  28295  +  474  smg protein  YP_266805  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0024  CDS  NC_003910  28415  28975  +  561  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  YP_266806  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0025  CDS  NC_003910  29054  30211  -  1158  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  YP_266807  normal  0.822133  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0026  CDS  NC_003910  30220  30702  -  483  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase catalytic subunit  YP_266808  normal  0.338359  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0027  CDS  NC_003910  30897  31448  +  552  putative RNA-binding protein  YP_266809  normal  0.667549  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0028  CDS  NC_003910  31497  31592  -  96  hypothetical protein  YP_266810  normal  0.920943  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0029  CDS  NC_003910  31667  32380  +  714  OmpW family outer membrane protein  YP_266811  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0030  CDS  NC_003910  32504  33331  +  828  shikimate 5-dehydrogenase  YP_266812  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0031  CDS  NC_003910  33346  33579  +  234  hypothetical protein  YP_266813  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0032  CDS  NC_003910  33576  34115  -  540  transferase hexapeptide domain-containing protein  YP_266814  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0033  CDS  NC_003910  34795  34899  -  105  hypothetical protein  YP_266815  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0034  rRNA  NC_003910  34936  36449  +  1514  16S ribosomal RNA    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0035  tRNA  NC_003910  36547  36623  +  77  tRNA-Ile    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0036  CDS  NC_003910  36736  36828  +  93  hypothetical protein  YP_266816  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0037  rRNA  NC_003910  37077  39970  +  2894  23S ribosomal RNA    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0038  rRNA  NC_003910  40130  40248  +  119  5S ribosomal RNA    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0039  rRNA  NC_003910  40354  40470  +  117  5S ribosomal RNA    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0040  tRNA  NC_003910  40608  40692  +  85  tRNA-Tyr    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0041  CDS  NC_003910  40709  42316  -  1608  response regulator  YP_266817  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0042  CDS  NC_003910  42397  43659  +  1263  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_266818  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0043  rRNA  NC_003910  44357  45868  +  1512  16S ribosomal RNA    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0044  tRNA  NC_003910  45969  46044  +  76  tRNA-Ala    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0045  CDS  NC_003910  46140  46343  +  204  hypothetical protein  YP_266819  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0046  rRNA  NC_003910  46481  49374  +  2894  23S ribosomal RNA    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0047  CDS  NC_003910  49350  49511  -  162  hypothetical protein  YP_266820  normal  0.541334  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0048  rRNA  NC_003910  49542  49660  +  119  5S ribosomal RNA    normal  0.147764  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0049  rRNA  NC_003910  50199  51712  +  1514  16S ribosomal RNA    normal  0.464241  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0050  tRNA  NC_003910  51813  51888  +  76  tRNA-Ala    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0051  CDS  NC_003910  51984  52076  +  93  hypothetical protein  YP_266821  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0052  rRNA  NC_003910  52325  55218  +  2894  23S ribosomal RNA    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0053  CDS  NC_003910  55194  55355  -  162  hypothetical protein  YP_266822  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0054  rRNA  NC_003910  55386  55504  +  119  5S ribosomal RNA    normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0055  CDS  NC_003910  56389  56775  +  387  ATP synthase protein I  YP_266823  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0056  CDS  NC_003910  56819  57604  +  786  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_266824  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0057  CDS  NC_003910  57703  57939  +  237  F0F1 ATP synthase subunit C  YP_266825  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0058  CDS  NC_003910  57987  58457  +  471  ATP synthase F0, B subunit  YP_266826  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0059  CDS  NC_003910  58470  59003  +  534  ATP synthase F1, delta subunit  YP_266827  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0060  CDS  NC_003910  59019  60560  +  1542  ATP synthase F1, alpha subunit  YP_266828  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0061  CDS  NC_003910  60598  61461  +  864  F0F1 ATP synthase subunit gamma  YP_266829  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0062  CDS  NC_003910  61562  62947  +  1386  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_266830  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0063  CDS  NC_003910  63009  63431  +  423  ATP synthase F1, epsilon subunit  YP_266831  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0064  CDS  NC_003910  63625  64536  -  912  hypothetical protein  YP_266832  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0065  CDS  NC_003910  64541  65194  -  654  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  YP_266833  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0066  CDS  NC_003910  65194  65460  -  267  hypothetical protein  YP_266834  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0067  CDS  NC_003910  65523  67703  -  2181  TonB-dependent receptor  YP_266835  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0068  CDS  NC_003910  68317  71787  +  3471  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  YP_266836  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0069  CDS  NC_003910  72137  73672  +  1536  FG-GAP repeat-containing protein  YP_266837  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0070  CDS  NC_003910  73721  73927  +  207  hypothetical protein  YP_266838  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0071  CDS  NC_003910  73992  75203  -  1212  hemY protein  YP_266839  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0072  CDS  NC_003910  75200  76618  -  1419  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  YP_266840  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0073  CDS  NC_003910  76642  77403  -  762  uroporphyrinogen-III synthase  YP_266841  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0074  CDS  NC_003910  77468  78421  -  954  porphobilinogen deaminase  YP_266842  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0075  CDS  NC_003910  78446  78766  -  321  cyaY protein  YP_266843  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0076  CDS  NC_003910  78921  79259  +  339  hypothetical protein  YP_266844  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0077  CDS  NC_003910  79259  80089  +  831  diaminopimelate epimerase  YP_266845  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0078  CDS  NC_003910  80150  80842  +  693  hypothetical protein  YP_266846  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0079  CDS  NC_003910  80867  81640  +  774  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  YP_266847  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0080  CDS  NC_003910  81800  83974  +  2175  DNA-dependent helicase II  YP_266848  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0081  CDS  NC_003910  84067  85326  +  1260  response regulator/GGDEF domain-containing protein  YP_266849  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0082  CDS  NC_003910  85484  86386  -  903  rarD protein  YP_266850  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0083  CDS  NC_003910  86632  88479  +  1848  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_266851  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0084  CDS  NC_003910  88771  88884  +  114  hypothetical protein  YP_266852  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0085  CDS  NC_003910  88978  89085  -  108  hypothetical protein  YP_266853  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0086  CDS  NC_003910  89242  91413  -  2172  prolyl endopeptidase  YP_266854  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0087  CDS  NC_003910  91611  93935  -  2325  fatty acid cis/trans isomerase  YP_266855  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0088  CDS  NC_003910  94117  94533  -  417  glyoxalase family protein  YP_266856  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0089  CDS  NC_003910  94589  94999  -  411  glyoxalase family protein  YP_266857  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0090  CDS  NC_003910  95064  95696  -  633  hypothetical protein  YP_266858  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0091  CDS  NC_003910  96139  96756  +  618  hypothetical protein  YP_266859  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0092  CDS  NC_003910  96846  98627  -  1782  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  YP_266860  normal  0.960352  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0093  CDS  NC_003910  98614  99234  -  621  hypothetical protein  YP_266861  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0094  CDS  NC_003910  99529  100497  -  969  membrane protein  YP_266862  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0095  CDS  NC_003910  100869  102281  -  1413  hypothetical protein  YP_266863  normal  0.0631849  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0096  CDS  NC_003910  102338  103813  -  1476  betaine aldehyde dehydrogenase  YP_266864  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0097  CDS  NC_003910  103871  104653  -  783  hypothetical protein  YP_266865  normal  0.590058  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0098  CDS  NC_003910  104755  106251  -  1497  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  YP_266866  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0099  CDS  NC_003910  106294  107631  -  1338  beta alanine--pyruvate transaminase  YP_266867  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0100  CDS  NC_003910  107752  108672  +  921  LysR family transcriptional regulator  YP_266868  normal  1  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>