295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0039 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0039  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0038  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0048  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0054  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0344  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0350  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0561  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0567  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1612  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3902  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0029  5S ribosomal RNA  92.93 
 
 		 115 bp  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0017a  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 		 120 bp  131  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0045  5S ribosomal RNA  91.51 
 
 		 118 bp  131  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.367607  normal  0.064154 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3096r  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 121 bp  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0017  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  115  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111845  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0027  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  115  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.905353  unclonable  0.00000755245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0109  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  115  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00459637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0011  5S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 120 bp  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.410694  normal  0.754666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0003  5S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 116 bp  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.701681  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0009  5S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 116 bp  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.10388  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0021  5S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 116 bp  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0054  5S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 116 bp  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0130  5S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 116 bp  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0095  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0491414  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0019  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0647157  hitchhiker  0.00427171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0106  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0633136  hitchhiker  0.000000553763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0082  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295466  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0100  5S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.390638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0010  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.137185  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_r003  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r006  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r009  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r010  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r013  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r016  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r019  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r022  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r025  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0003  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.530292  hitchhiker  0.00148458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0011  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0219912  normal  0.295401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0018  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000474552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0075  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0121  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.777724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0130  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0134  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00025818  hitchhiker  0.00693749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0138  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0141  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0395  hypothetical protein  89.8 
 
 		 129 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000730757  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0003  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377147  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0011  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0018  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0024  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000358593  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0028  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0075  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0121  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0139  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0142  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0003  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95198  hitchhiker  0.000000732867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0018  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0073  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.568148  normal  0.279617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0118  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0128  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.875771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130a  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000239315  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0132  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000272918  normal  0.0785427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0138  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0141  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0004  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0280909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0013  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.843481  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0064  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.050836  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0074  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0076  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0094  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0084  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0100  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0012  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0004  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.843382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0073  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0081  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0075  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0031  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.693332  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0097  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0092  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4192  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 120 bp  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00523056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4290  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 120 bp  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00943464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0099  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0795663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0101  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.068415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0104  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0033867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0016  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0354565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4282  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 120 bp  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000174776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4196  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 120 bp  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000940838  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0103  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4262  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 120 bp  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0215297  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4218  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 120 bp  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00106979  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3398  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.495724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3468  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.119898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0131  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0232542  normal  0.0763062 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1923  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0302252  normal  0.557773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0472  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000566634  normal  0.0381897 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0630  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000525893  normal  0.0738312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0102  5S ribosomal RNA  93.15 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>