More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0013 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0013  proline dipeptidase  100 
 
 		 443 aa  927    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0020  proline dipeptidase  57.24 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0021  proline dipeptidase  56.29 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0017  proline dipeptidase  56.52 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0021  proline dipeptidase  56.06 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0014  proline dipeptidase  56.98 
 
 		 440 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.258964  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0022  proline dipeptidase  56.65 
 
 		 439 aa  544  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0024  proline dipeptidase  56.88 
 
 		 439 aa  541  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.0225878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0022  proline dipeptidase  56.52 
 
 		 439 aa  544  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324765  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0016  proline dipeptidase  56.19 
 
 		 440 aa  542  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.98827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0019  proline dipeptidase  56.65 
 
 		 439 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0806227  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0017  proline dipeptidase  56.65 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.767781  normal  0.0779588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0014  proline dipeptidase  57.34 
 
 		 439 aa  541  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0022  proline dipeptidase  56.29 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0718408  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0025  proline dipeptidase  56.65 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000000409434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0199  proline dipeptidase  59.64 
 
 		 443 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03734  proline dipeptidase  57.63 
 
 		 448 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0033  proline dipeptidase  56.42 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.12189  normal  0.0842725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0019  proline dipeptidase  55.61 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4233  proline dipeptidase  49.89 
 
 		 443 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4043  proline dipeptidase  49.89 
 
 		 443 aa  461  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03738  proline dipeptidase  47.95 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4134  peptidase M24  47.95 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.689702  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4366  proline dipeptidase  47.95 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000311805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4163  proline dipeptidase  47.95 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215567  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4070  proline dipeptidase  47.95 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03687  hypothetical protein  47.95 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3900  proline dipeptidase  48.64 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.022198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4228  proline dipeptidase  47.95 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000144079  normal  0.0133545 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1913  proline dipeptidase  47.95 
 
 		 443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137948  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0284  proline dipeptidase  47.95 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3948  proline dipeptidase  48.18 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  0.023319 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4317  proline dipeptidase  47.73 
 
 		 443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00026447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3932  proline dipeptidase  47.95 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5286  proline dipeptidase  47.73 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0321906  normal  0.0291317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4310  proline dipeptidase  47.27 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.554834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4191  proline dipeptidase  47.27 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4370  proline dipeptidase  47.27 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4214  proline dipeptidase  47.27 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0112386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4263  proline dipeptidase  47.27 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3746  proline dipeptidase  46.59 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0139114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0263  proline dipeptidase  45.91 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00615185  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3276  proline dipeptidase  43.85 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02375  proline dipeptidase  42.66 
 
 		 492 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5810  peptidase M24  37.14 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0455  proline dipeptidase  37.93 
 
 		 429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3908  proline dipeptidase  34.93 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  28.11 
 
 		 465 aa  159  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  28.69 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  28.78 
 
 		 439 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  35.11 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  27.54 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  30.95 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  28.28 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1467  Xaa-Pro dipeptidase  31.79 
 
 		 493 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_29983  predicted protein  32.17 
 
 		 524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02200  prolidase, putative  26.67 
 
 		 546 aa  120  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.555786  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  28.45 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  25.89 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  30.64 
 
 		 464 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  31.16 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0500  putative aminopeptidase P  31.15 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0229386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  32.14 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  24.95 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  28.47 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  31.45 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  26.03 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  29.87 
 
 		 514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  28.3 
 
 		 435 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4336  peptidase M24  29.27 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  31.47 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  24.89 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  29.79 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  27.99 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  27.4 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  26.18 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  26.3 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  30.41 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  26.46 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  30.41 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  26.09 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  30.69 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  26.39 
 
 		 461 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  28.9 
 
 		 499 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.106603 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  30.42 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  30.42 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  28.99 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2176  aminopeptidase P  28.01 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  30.42 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  30.42 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  30.42 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  30.42 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  29.32 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  31.03 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  29.17 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  26.07 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  29.21 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  30.93 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  26.07 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04951  putative aminopeptidase P  31.27 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>