More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02375 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02375  proline dipeptidase  100 
 
 
492 aa  1010    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3276  proline dipeptidase  76.42 
 
 
443 aa  694    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3932  proline dipeptidase  49.54 
 
 
443 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1913  proline dipeptidase  49.31 
 
 
443 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137948  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0284  proline dipeptidase  49.54 
 
 
443 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4043  proline dipeptidase  50.23 
 
 
443 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4233  proline dipeptidase  49.77 
 
 
443 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118401  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0014  proline dipeptidase  47.8 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.258964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3900  proline dipeptidase  47.94 
 
 
443 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.022198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0016  proline dipeptidase  46.39 
 
 
440 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.98827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0019  proline dipeptidase  46.19 
 
 
440 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03738  proline dipeptidase  46.79 
 
 
443 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4134  peptidase M24  46.79 
 
 
443 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.689702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0021  proline dipeptidase  47.1 
 
 
440 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0022  proline dipeptidase  47.56 
 
 
439 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3746  proline dipeptidase  47.48 
 
 
443 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0139114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0022  proline dipeptidase  46.85 
 
 
439 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324765  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4366  proline dipeptidase  46.79 
 
 
443 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000311805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0020  proline dipeptidase  47.48 
 
 
440 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930691  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0024  proline dipeptidase  46.56 
 
 
439 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.0225878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0022  proline dipeptidase  47.1 
 
 
440 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0718408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4070  proline dipeptidase  46.79 
 
 
443 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0021  proline dipeptidase  47.1 
 
 
440 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0017  proline dipeptidase  47.1 
 
 
440 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4228  proline dipeptidase  46.79 
 
 
443 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000144079  normal  0.0133545 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03687  hypothetical protein  46.79 
 
 
443 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4163  proline dipeptidase  46.79 
 
 
443 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215567  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5286  proline dipeptidase  46.56 
 
 
443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0321906  normal  0.0291317 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4317  proline dipeptidase  46.1 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00026447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0019  proline dipeptidase  46.87 
 
 
439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0806227  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0017  proline dipeptidase  46.64 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.767781  normal  0.0779588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0025  proline dipeptidase  46.64 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000000409434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0263  proline dipeptidase  46.35 
 
 
443 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00615185  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0014  proline dipeptidase  46.08 
 
 
439 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3948  proline dipeptidase  45.87 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  0.023319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0033  proline dipeptidase  45.41 
 
 
439 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.12189  normal  0.0842725 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4191  proline dipeptidase  45.64 
 
 
443 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4263  proline dipeptidase  45.64 
 
 
443 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4370  proline dipeptidase  45.64 
 
 
443 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4214  proline dipeptidase  45.64 
 
 
443 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0112386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4310  proline dipeptidase  45.64 
 
 
443 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.554834 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03734  proline dipeptidase  45.24 
 
 
448 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0199  proline dipeptidase  46.67 
 
 
443 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0013  proline dipeptidase  42.66 
 
 
443 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0455  proline dipeptidase  41.06 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3908  proline dipeptidase  38.9 
 
 
433 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5810  peptidase M24  37.79 
 
 
470 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  36.3 
 
 
429 aa  149  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  28.38 
 
 
465 aa  143  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1467  Xaa-Pro dipeptidase  33.63 
 
 
493 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  32.18 
 
 
475 aa  140  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106037 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  34.39 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  34.19 
 
 
455 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  35.38 
 
 
463 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  33.44 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0766  peptidase M24  32.98 
 
 
459 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.498025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  33.57 
 
 
458 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  33.11 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0811  Xaa-Pro dipeptidase  32.42 
 
 
471 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  33.33 
 
 
465 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  29.81 
 
 
490 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_29983  predicted protein  30.98 
 
 
524 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  31.58 
 
 
444 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  30.33 
 
 
454 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02200  prolidase, putative  36.19 
 
 
546 aa  116  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.555786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  31.99 
 
 
439 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  31.25 
 
 
439 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  32.3 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  32.3 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  32.3 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  30.65 
 
 
444 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  30.65 
 
 
444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  30.65 
 
 
444 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  30.82 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  33.02 
 
 
465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  30.38 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5472  Xaa-Pro dipeptidase  38.92 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  31.93 
 
 
437 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  28.9 
 
 
436 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  32.04 
 
 
461 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  30 
 
 
444 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  30.45 
 
 
452 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  30.74 
 
 
444 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3277  peptidase M24  32.26 
 
 
442 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.609187  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  30.46 
 
 
439 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  28.19 
 
 
435 aa  107  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  30.17 
 
 
434 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  30.34 
 
 
473 aa  107  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  30.53 
 
 
441 aa  107  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  29.05 
 
 
441 aa  106  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  29.9 
 
 
441 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  30.03 
 
 
439 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  30.9 
 
 
441 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  28.33 
 
 
437 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  29.79 
 
 
444 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  30.53 
 
 
441 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  29.79 
 
 
438 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  28.99 
 
 
444 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  28.34 
 
 
444 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  28.34 
 
 
444 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>