More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0811 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0811  Xaa-Pro dipeptidase  100 
 
 
471 aa  957    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  48.92 
 
 
464 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  44.37 
 
 
465 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5472  Xaa-Pro dipeptidase  46.77 
 
 
472 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  44.25 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  37.33 
 
 
458 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  37.58 
 
 
451 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  37.62 
 
 
463 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  37.36 
 
 
451 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  37.65 
 
 
455 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0766  peptidase M24  36.08 
 
 
459 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.498025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1467  Xaa-Pro dipeptidase  37.19 
 
 
493 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  30.34 
 
 
439 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  32.22 
 
 
446 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  32.22 
 
 
446 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  31.81 
 
 
434 aa  191  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  32.41 
 
 
436 aa  189  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  31.84 
 
 
436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  31.74 
 
 
490 aa  179  9e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1535  putative aminopeptidase P  29.79 
 
 
441 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.999654  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  29.87 
 
 
439 aa  177  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  29.49 
 
 
465 aa  176  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  28.9 
 
 
461 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  31.43 
 
 
444 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  31.19 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  31.2 
 
 
439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  32.72 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  31.67 
 
 
444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  31.79 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  31.42 
 
 
439 aa  173  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  31.39 
 
 
444 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  29.42 
 
 
441 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  29.42 
 
 
441 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  31.58 
 
 
444 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  29.42 
 
 
441 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  32.07 
 
 
442 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  29.42 
 
 
441 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  29.42 
 
 
441 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  32.79 
 
 
461 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  31.81 
 
 
439 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  31.21 
 
 
444 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  29.21 
 
 
441 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16211  putative aminopeptidase P  27.27 
 
 
441 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.878711  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  32.18 
 
 
454 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  30.8 
 
 
444 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  31.62 
 
 
443 aa  168  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  28.81 
 
 
441 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1254  Xaa-Pro aminopeptidase  32.7 
 
 
611 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  32.12 
 
 
464 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  31.92 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  31.98 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  31.3 
 
 
462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  30.04 
 
 
436 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16441  putative aminopeptidase P  27.92 
 
 
441 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.689084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  31.44 
 
 
454 aa  167  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  29 
 
 
441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  31.63 
 
 
465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  30.72 
 
 
437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  30.06 
 
 
443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  30.39 
 
 
444 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  31.79 
 
 
514 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  31.59 
 
 
429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16321  putative aminopeptidase P  27.92 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  31.5 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  31.72 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  32.14 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  29.29 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  31.56 
 
 
473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  28.78 
 
 
441 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3394  xaa-pro aminopeptidase  32.7 
 
 
469 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  28.78 
 
 
441 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  31.49 
 
 
444 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  32.23 
 
 
444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3399  aminopeptidase P  32.36 
 
 
642 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612294  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  31.47 
 
 
449 aa  163  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  32.79 
 
 
461 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  32.79 
 
 
461 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  27.72 
 
 
458 aa  162  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  29.49 
 
 
439 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2360  Xaa-Pro aminopeptidase  32.85 
 
 
468 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  32.79 
 
 
461 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  29.85 
 
 
438 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  29.85 
 
 
438 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1135  Xaa-Pro aminopeptidase  32.85 
 
 
481 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  31.99 
 
 
454 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  29.49 
 
 
439 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2540  Xaa-Pro aminopeptidase  32.85 
 
 
481 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0274  Xaa-Pro aminopeptidase  32.85 
 
 
481 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3358  xaa-pro aminopeptidase  32.36 
 
 
469 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0463  peptidase M24  31.15 
 
 
500 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  31 
 
 
442 aa  161  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  30.88 
 
 
458 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  30.17 
 
 
438 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  30.17 
 
 
438 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  31.17 
 
 
436 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  36.54 
 
 
437 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  29.65 
 
 
438 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  30.06 
 
 
437 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  31.52 
 
 
459 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  29.66 
 
 
439 aa  159  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>