More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3422 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  100 
 
 
464 aa  941    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0811  Xaa-Pro dipeptidase  48.92 
 
 
471 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  44.47 
 
 
465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5472  Xaa-Pro dipeptidase  46.05 
 
 
472 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  39.47 
 
 
461 aa  359  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  38.19 
 
 
455 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  38.26 
 
 
451 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  38.26 
 
 
451 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  37.53 
 
 
463 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  36.32 
 
 
458 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0766  peptidase M24  38.46 
 
 
459 aa  285  8e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.498025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1467  Xaa-Pro dipeptidase  38.98 
 
 
493 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  32.58 
 
 
454 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  31.05 
 
 
436 aa  186  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  30.48 
 
 
439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  30.15 
 
 
437 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  28.87 
 
 
441 aa  180  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  32.43 
 
 
444 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  28.87 
 
 
441 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  28.66 
 
 
441 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  28.66 
 
 
441 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  28.66 
 
 
441 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  28.66 
 
 
441 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  28.66 
 
 
441 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  28.66 
 
 
441 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  30.35 
 
 
434 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  28.66 
 
 
441 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  31.65 
 
 
446 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  31.65 
 
 
446 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  28.87 
 
 
438 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  28.87 
 
 
438 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  28.87 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  28.87 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  32.33 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  28.97 
 
 
441 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  29.75 
 
 
443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  30.69 
 
 
439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  31.63 
 
 
465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  29.25 
 
 
436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  28.66 
 
 
438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  28.48 
 
 
439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  30.95 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  30.8 
 
 
444 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  28.27 
 
 
441 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  30.41 
 
 
441 aa  170  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  28.66 
 
 
443 aa  169  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  30.42 
 
 
444 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  30.62 
 
 
444 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  31.09 
 
 
439 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  29.42 
 
 
461 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  27.62 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  30.77 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  30.56 
 
 
439 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  26.37 
 
 
436 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  31.82 
 
 
445 aa  167  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  28.6 
 
 
436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  29.27 
 
 
437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  31.79 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  31.17 
 
 
444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  32.32 
 
 
429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  29.38 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  29.39 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  31.71 
 
 
447 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  29.39 
 
 
437 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  28.3 
 
 
439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  29.18 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  31.78 
 
 
436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  31.81 
 
 
444 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  28.15 
 
 
436 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  30.95 
 
 
444 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  30.21 
 
 
452 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  29.81 
 
 
444 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  31.42 
 
 
454 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  29.56 
 
 
461 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  28.14 
 
 
439 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  29.78 
 
 
496 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  30.37 
 
 
432 aa  160  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  28.63 
 
 
461 aa  160  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  30.79 
 
 
439 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  29.2 
 
 
444 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  28.98 
 
 
437 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4336  peptidase M24  34.34 
 
 
389 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1535  putative aminopeptidase P  27.78 
 
 
441 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.999654  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3034  aminopeptidase P  29.53 
 
 
428 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16211  putative aminopeptidase P  26.65 
 
 
441 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.878711  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0075  aminopeptidase P  31.9 
 
 
437 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.819876  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  28.73 
 
 
440 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  30.66 
 
 
499 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  27.42 
 
 
475 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3497  Xaa-Pro aminopeptidase  30.24 
 
 
539 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434008  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  29.66 
 
 
490 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  29.48 
 
 
437 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  31.78 
 
 
439 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  30.52 
 
 
454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  29.67 
 
 
464 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2008  Xaa-Pro aminopeptidase  29 
 
 
427 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  29.3 
 
 
514 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  29.77 
 
 
462 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  29.11 
 
 
435 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  28.8 
 
 
458 aa  153  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>