More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0463 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0543  peptidase M24  91 
 
 		 500 aa  926    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0463  peptidase M24  100 
 
 		 500 aa  1024    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19260  Xaa-Pro aminopeptidase  62.83 
 
 		 494 aa  625  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00637043  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0703  peptidase M24  57.71 
 
 		 517 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27810  Xaa-Pro aminopeptidase  58.76 
 
 		 522 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.517657  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2910  peptidase M24  56.38 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0334658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2788  Xaa-Pro aminopeptidase  53.2 
 
 		 530 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.364809  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2481  peptidase M24  55.51 
 
 		 517 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0769  peptidase M24  56.04 
 
 		 521 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2508  Xaa-Pro aminopeptidase  52.6 
 
 		 531 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000105082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11300  Xaa-Pro aminopeptidase  54 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15300  Xaa-Pro aminopeptidase  54.77 
 
 		 532 aa  492  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0288526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1161  Xaa-Pro aminopeptidase  51.83 
 
 		 531 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398312  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0216  aminopeptidase P  47.99 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56198  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1246  Xaa-Pro aminopeptidase  49.9 
 
 		 627 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623221  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1744  xaa-Pro aminopeptidase  49.69 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0389057  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3497  Xaa-Pro aminopeptidase  49.69 
 
 		 539 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434008  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0463  peptidase, M24 family  45.38 
 
 		 531 aa  444  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  48.54 
 
 		 496 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3284  Xaa-Pro aminopeptidase  47.46 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.331819  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5913  Xaa-Pro aminopeptidase  45.64 
 
 		 479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.117741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3026  hypothetical protein  45.29 
 
 		 485 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3058  Xaa-Pro aminopeptidase  47.57 
 
 		 492 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.11104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1364  Xaa-Pro aminopeptidase  47.16 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3048  peptidase M24  44.98 
 
 		 501 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.178755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4713  Xaa-Pro aminopeptidase  43.45 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0669  Xaa-Pro aminopeptidase  42.89 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.519514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  35.53 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  35.37 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  32.46 
 
 		 461 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  34.05 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  33.33 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  34.56 
 
 		 454 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  33.69 
 
 		 444 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  33.7 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  34.85 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  34.33 
 
 		 445 aa  207  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  33.26 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  33.7 
 
 		 446 aa  206  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  33.7 
 
 		 446 aa  206  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  33.04 
 
 		 436 aa  206  9e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  33.41 
 
 		 437 aa  204  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  34.39 
 
 		 454 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  34.16 
 
 		 414 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  31.16 
 
 		 441 aa  202  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  32.3 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  33.55 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  32.3 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  32.3 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  32.3 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  32.3 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  32.52 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  33.26 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  34.66 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  33.33 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  36.64 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  33.26 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  32.08 
 
 		 441 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  35.67 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  33.77 
 
 		 444 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  32.97 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  33.63 
 
 		 464 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  32.97 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  33.05 
 
 		 437 aa  200  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  32.08 
 
 		 441 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  33.55 
 
 		 444 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  33.26 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  33.19 
 
 		 438 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  31.68 
 
 		 441 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  32.97 
 
 		 443 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  36.15 
 
 		 437 aa  199  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  33.76 
 
 		 439 aa  199  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  32.4 
 
 		 449 aa  199  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  31.4 
 
 		 439 aa  199  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  32.97 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  33.55 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  32.97 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  34.73 
 
 		 461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  32.83 
 
 		 437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  30.15 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  34.73 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  32.83 
 
 		 437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  32.98 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  34.73 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  33.41 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  34.41 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  32.76 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  34.23 
 
 		 462 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  33.92 
 
 		 459 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  34.43 
 
 		 474 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  32.69 
 
 		 444 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  32.4 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  33.2 
 
 		 441 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3287  aminopeptidase P  33.98 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  33.04 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16211  putative aminopeptidase P  31 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.878711  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  31.24 
 
 		 473 aa  194  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  33.48 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  32.19 
 
 		 441 aa  192  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16441  putative aminopeptidase P  30.45 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.689084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>