More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0463 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0463  peptidase, M24 family  100 
 
 		 531 aa  1109    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0216  aminopeptidase P  75.98 
 
 		 531 aa  825    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56198  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2788  Xaa-Pro aminopeptidase  53.15 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.364809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2508  Xaa-Pro aminopeptidase  51.79 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000105082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11300  Xaa-Pro aminopeptidase  51.2 
 
 		 515 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27810  Xaa-Pro aminopeptidase  50 
 
 		 522 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.517657  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0703  peptidase M24  50.68 
 
 		 517 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15300  Xaa-Pro aminopeptidase  50.19 
 
 		 532 aa  491  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0288526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2481  peptidase M24  50.89 
 
 		 517 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2910  peptidase M24  50 
 
 		 513 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0334658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1161  Xaa-Pro aminopeptidase  47.62 
 
 		 531 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398312  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19260  Xaa-Pro aminopeptidase  47.01 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00637043  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0769  peptidase M24  48.4 
 
 		 521 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0543  peptidase M24  44.01 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0463  peptidase M24  44.6 
 
 		 500 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3497  Xaa-Pro aminopeptidase  44.02 
 
 		 539 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434008  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1246  Xaa-Pro aminopeptidase  43.66 
 
 		 627 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623221  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5913  Xaa-Pro aminopeptidase  42.8 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.117741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3026  hypothetical protein  41.82 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1744  xaa-Pro aminopeptidase  41.9 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0389057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3284  Xaa-Pro aminopeptidase  41.61 
 
 		 492 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.331819  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  41.86 
 
 		 496 aa  364  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3048  peptidase M24  41.07 
 
 		 501 aa  363  6e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.178755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1364  Xaa-Pro aminopeptidase  41.44 
 
 		 480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3058  Xaa-Pro aminopeptidase  41.82 
 
 		 492 aa  352  8e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.11104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4713  Xaa-Pro aminopeptidase  41.28 
 
 		 453 aa  344  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0669  Xaa-Pro aminopeptidase  39.47 
 
 		 506 aa  296  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.519514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  35.24 
 
 		 439 aa  226  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  31.45 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  32.97 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  33.54 
 
 		 443 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  32.33 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  33.97 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  34.23 
 
 		 414 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  33.19 
 
 		 445 aa  207  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  31.75 
 
 		 443 aa  207  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  33.47 
 
 		 441 aa  206  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  32.77 
 
 		 449 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  33.33 
 
 		 441 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  33.77 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  32.84 
 
 		 441 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  33.77 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  33.05 
 
 		 441 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  32.53 
 
 		 454 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  30.91 
 
 		 439 aa  199  7.999999999999999e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16321  putative aminopeptidase P  32.01 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1535  putative aminopeptidase P  31.24 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3406  peptidase M24  34.07 
 
 		 439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  33.12 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16441  putative aminopeptidase P  31.94 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.689084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  32.58 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  32.83 
 
 		 436 aa  195  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3287  aminopeptidase P  33.63 
 
 		 439 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  32.29 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  31.86 
 
 		 443 aa  194  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  33.63 
 
 		 439 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  32.36 
 
 		 444 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  33.05 
 
 		 436 aa  193  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  31.08 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  31.08 
 
 		 437 aa  193  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  30.74 
 
 		 444 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  30.23 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  30.84 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  32.1 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  30.74 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  33.49 
 
 		 439 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16211  putative aminopeptidase P  30.36 
 
 		 441 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.878711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  31.89 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  31.26 
 
 		 444 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  32.9 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  31.89 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  31.89 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  31.89 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  31.89 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  31.67 
 
 		 441 aa  189  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  31.67 
 
 		 441 aa  189  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  31.97 
 
 		 514 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  31.67 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  31.34 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15611  putative aminopeptidase P  35.65 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  31.34 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  30.21 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  32.43 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  34.44 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  31.56 
 
 		 438 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  31.34 
 
 		 438 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1524  aminopeptidase P  31.8 
 
 		 430 aa  187  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0210879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  31.34 
 
 		 438 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  32.12 
 
 		 439 aa  186  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  33.03 
 
 		 439 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  29.62 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  32.97 
 
 		 440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  31.97 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0075  aminopeptidase P  33.61 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.819876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  32.02 
 
 		 439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  31.1 
 
 		 436 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  32.02 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  32.59 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  31.74 
 
 		 461 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2008  Xaa-Pro aminopeptidase  29.71 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>