More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5913 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5913  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 
479 aa  973    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.117741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3026  hypothetical protein  60.38 
 
 
485 aa  535  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371116  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1744  xaa-Pro aminopeptidase  53.29 
 
 
510 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0389057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3284  Xaa-Pro aminopeptidase  51.56 
 
 
492 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.331819  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3058  Xaa-Pro aminopeptidase  51.26 
 
 
492 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.11104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1364  Xaa-Pro aminopeptidase  52.43 
 
 
480 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  51.48 
 
 
496 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3048  peptidase M24  48.85 
 
 
501 aa  435  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.178755  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0703  peptidase M24  48.97 
 
 
517 aa  430  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1246  Xaa-Pro aminopeptidase  48.97 
 
 
627 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623221  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2788  Xaa-Pro aminopeptidase  49.29 
 
 
530 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.364809  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2481  peptidase M24  49.16 
 
 
517 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1161  Xaa-Pro aminopeptidase  47.15 
 
 
531 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398312  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3497  Xaa-Pro aminopeptidase  48.17 
 
 
539 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434008  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15300  Xaa-Pro aminopeptidase  50.1 
 
 
532 aa  415  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0288526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27810  Xaa-Pro aminopeptidase  48.54 
 
 
522 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.517657  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2508  Xaa-Pro aminopeptidase  45.56 
 
 
531 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000105082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2910  peptidase M24  47.61 
 
 
513 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0334658 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0463  peptidase, M24 family  42.8 
 
 
531 aa  395  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19260  Xaa-Pro aminopeptidase  46.12 
 
 
494 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00637043  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0463  peptidase M24  45.44 
 
 
500 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0543  peptidase M24  44.83 
 
 
500 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0216  aminopeptidase P  43.5 
 
 
531 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56198  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11300  Xaa-Pro aminopeptidase  44.17 
 
 
515 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0769  peptidase M24  46.64 
 
 
521 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0669  Xaa-Pro aminopeptidase  50.11 
 
 
506 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.519514  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4713  Xaa-Pro aminopeptidase  42.92 
 
 
453 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  33.8 
 
 
446 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  33.8 
 
 
446 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  34.51 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  34.94 
 
 
436 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  35.09 
 
 
436 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  33.89 
 
 
473 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  34.91 
 
 
454 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  33.33 
 
 
439 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  34.99 
 
 
465 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  31.4 
 
 
443 aa  206  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  34.28 
 
 
440 aa  206  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  31.06 
 
 
444 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  35.6 
 
 
458 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  31.97 
 
 
439 aa  203  5e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  30.85 
 
 
444 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  32.81 
 
 
439 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  33.71 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  35.6 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  35.84 
 
 
414 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  34.01 
 
 
437 aa  201  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  31.75 
 
 
454 aa  199  9e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  34.75 
 
 
461 aa  199  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  32.51 
 
 
434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  32.88 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  35.28 
 
 
464 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  31.07 
 
 
436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  35.51 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  32.65 
 
 
437 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  32.65 
 
 
437 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  33.33 
 
 
464 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  31.29 
 
 
439 aa  196  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  34.47 
 
 
468 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  32.1 
 
 
445 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  32.66 
 
 
437 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  35.84 
 
 
514 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  30.65 
 
 
439 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  35.55 
 
 
474 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  32.81 
 
 
435 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  30.74 
 
 
444 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  34.08 
 
 
442 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  29.28 
 
 
461 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  32.38 
 
 
443 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  30.74 
 
 
444 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  35.97 
 
 
461 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  35.97 
 
 
461 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  35.97 
 
 
461 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  33.01 
 
 
441 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  34.23 
 
 
458 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  33.86 
 
 
442 aa  190  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  32.95 
 
 
499 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  30.59 
 
 
444 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  30.52 
 
 
444 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  31.66 
 
 
437 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  31.71 
 
 
438 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  32.96 
 
 
441 aa  190  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  35.32 
 
 
432 aa  190  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  31.71 
 
 
438 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  30.17 
 
 
444 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  32.13 
 
 
441 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  32.71 
 
 
449 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  32.21 
 
 
441 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  34.12 
 
 
446 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  33.33 
 
 
436 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  34.17 
 
 
459 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  31.49 
 
 
438 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  30.56 
 
 
444 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  31.49 
 
 
438 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  32.28 
 
 
441 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  32.44 
 
 
441 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  33.33 
 
 
433 aa  187  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3287  aminopeptidase P  33.95 
 
 
439 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  33.26 
 
 
462 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  33.18 
 
 
442 aa  187  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>