More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3284 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3284  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 
492 aa  992    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.331819  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3058  Xaa-Pro aminopeptidase  88.62 
 
 
492 aa  863    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.11104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3048  peptidase M24  66.87 
 
 
501 aa  631  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.178755  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1744  xaa-Pro aminopeptidase  57.97 
 
 
510 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0389057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1364  Xaa-Pro aminopeptidase  58.56 
 
 
480 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1246  Xaa-Pro aminopeptidase  53.86 
 
 
627 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623221  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3497  Xaa-Pro aminopeptidase  53.5 
 
 
539 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434008  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5913  Xaa-Pro aminopeptidase  51.56 
 
 
479 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.117741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  54.51 
 
 
496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3026  hypothetical protein  52.71 
 
 
485 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371116  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2508  Xaa-Pro aminopeptidase  47.34 
 
 
531 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000105082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2788  Xaa-Pro aminopeptidase  46.95 
 
 
530 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.364809  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2481  peptidase M24  50.31 
 
 
517 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0703  peptidase M24  48.21 
 
 
517 aa  418  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27810  Xaa-Pro aminopeptidase  51.46 
 
 
522 aa  418  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.517657  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0543  peptidase M24  48.95 
 
 
500 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19260  Xaa-Pro aminopeptidase  48.54 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00637043  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2910  peptidase M24  49.03 
 
 
513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0334658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1161  Xaa-Pro aminopeptidase  49.36 
 
 
531 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398312  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0463  peptidase M24  47.46 
 
 
500 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15300  Xaa-Pro aminopeptidase  50 
 
 
532 aa  396  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0288526  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0669  Xaa-Pro aminopeptidase  50.21 
 
 
506 aa  398  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.519514  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0216  aminopeptidase P  44.74 
 
 
531 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56198  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11300  Xaa-Pro aminopeptidase  48.23 
 
 
515 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0769  peptidase M24  47.64 
 
 
521 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0463  peptidase, M24 family  41.61 
 
 
531 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4713  Xaa-Pro aminopeptidase  44.06 
 
 
453 aa  350  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  34.43 
 
 
441 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  35.33 
 
 
439 aa  237  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  35.41 
 
 
434 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  33.63 
 
 
443 aa  227  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  35.37 
 
 
454 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  36.14 
 
 
438 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  36.14 
 
 
438 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  32.9 
 
 
461 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  35.92 
 
 
438 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  35.92 
 
 
438 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  34.43 
 
 
437 aa  223  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  35.7 
 
 
438 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  34.15 
 
 
441 aa  220  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  34.81 
 
 
441 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  35.49 
 
 
437 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  35.49 
 
 
437 aa  219  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  35.03 
 
 
441 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  35.49 
 
 
437 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  35.03 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  35.03 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  34.81 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  35.03 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  35.03 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  34.81 
 
 
441 aa  217  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  35.03 
 
 
441 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  34.15 
 
 
441 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  33.11 
 
 
439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  35.68 
 
 
446 aa  216  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  35.68 
 
 
446 aa  216  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  32.96 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  34.16 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  34.08 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  35.1 
 
 
445 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  34.08 
 
 
449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  34.52 
 
 
439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  34.38 
 
 
437 aa  213  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  35.17 
 
 
464 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  35.23 
 
 
464 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  34.44 
 
 
444 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  33.56 
 
 
436 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  31.71 
 
 
437 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  32.81 
 
 
439 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  32.16 
 
 
436 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  34.88 
 
 
461 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  36.83 
 
 
446 aa  210  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  33.61 
 
 
473 aa  210  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  33.11 
 
 
444 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  36 
 
 
437 aa  209  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  34.58 
 
 
444 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  35.9 
 
 
414 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  33.78 
 
 
436 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  34.96 
 
 
461 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  33.41 
 
 
439 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  34.45 
 
 
514 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  33.7 
 
 
444 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  35.73 
 
 
436 aa  207  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  34.96 
 
 
461 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  34.96 
 
 
461 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  33.55 
 
 
444 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  32.89 
 
 
436 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  35.03 
 
 
441 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  34.96 
 
 
461 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  33.97 
 
 
464 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  32.97 
 
 
443 aa  203  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  33.26 
 
 
444 aa  204  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  34.91 
 
 
442 aa  203  6e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  33.99 
 
 
442 aa  203  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  33.94 
 
 
454 aa  202  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  35.08 
 
 
499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  34.32 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  35.11 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  34.9 
 
 
474 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  36.51 
 
 
439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>