More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4713 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4713  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 		 453 aa  904    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1744  xaa-Pro aminopeptidase  46.39 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0389057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1246  Xaa-Pro aminopeptidase  46.35 
 
 		 627 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623221  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19260  Xaa-Pro aminopeptidase  44.94 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00637043  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0216  aminopeptidase P  40.95 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3048  peptidase M24  43.66 
 
 		 501 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.178755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3497  Xaa-Pro aminopeptidase  44.23 
 
 		 539 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434008  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3284  Xaa-Pro aminopeptidase  44.06 
 
 		 492 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.331819  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27810  Xaa-Pro aminopeptidase  44.86 
 
 		 522 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.517657  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0463  peptidase, M24 family  39.47 
 
 		 531 aa  347  3e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0463  peptidase M24  42.62 
 
 		 500 aa  346  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0543  peptidase M24  43.36 
 
 		 500 aa  346  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3058  Xaa-Pro aminopeptidase  44.06 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.11104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  45.99 
 
 		 496 aa  335  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0703  peptidase M24  41.29 
 
 		 517 aa  332  7.000000000000001e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1364  Xaa-Pro aminopeptidase  42.32 
 
 		 480 aa  329  7e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1161  Xaa-Pro aminopeptidase  42.68 
 
 		 531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398312  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0669  Xaa-Pro aminopeptidase  45 
 
 		 506 aa  326  5e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.519514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2910  peptidase M24  43.84 
 
 		 513 aa  326  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0334658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5913  Xaa-Pro aminopeptidase  42.92 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.117741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2788  Xaa-Pro aminopeptidase  41.1 
 
 		 530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.364809  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0769  peptidase M24  42.33 
 
 		 521 aa  319  7.999999999999999e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2481  peptidase M24  42.77 
 
 		 517 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2508  Xaa-Pro aminopeptidase  40.9 
 
 		 531 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000105082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3026  hypothetical protein  43.06 
 
 		 485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11300  Xaa-Pro aminopeptidase  40.13 
 
 		 515 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15300  Xaa-Pro aminopeptidase  43.57 
 
 		 532 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0288526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  33.33 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16211  putative aminopeptidase P  27.64 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.878711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  32.56 
 
 		 441 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  32.18 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  30.07 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  31.59 
 
 		 441 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  32.27 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  32.26 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15611  putative aminopeptidase P  32.32 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  30.61 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  31.94 
 
 		 437 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16321  putative aminopeptidase P  28.57 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  32.79 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3406  peptidase M24  33.03 
 
 		 439 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  31.72 
 
 		 437 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  31.72 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  31.94 
 
 		 444 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  31.46 
 
 		 439 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  33.41 
 
 		 436 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  31.75 
 
 		 441 aa  176  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  31.16 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3287  aminopeptidase P  33.49 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  31.16 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  28.67 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  31.22 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  32.34 
 
 		 439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  29.38 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16441  putative aminopeptidase P  27.21 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.689084  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  31.83 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  27.99 
 
 		 439 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  31.28 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1535  putative aminopeptidase P  26.86 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.999654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  32.73 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  32.27 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  30.18 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  32.82 
 
 		 445 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  31.47 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  27.54 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  31.49 
 
 		 473 aa  169  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  29.8 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  31.07 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  30.26 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  30.48 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  31.05 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  31.72 
 
 		 444 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  30.26 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  30.26 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  30.26 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  31.13 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  31.39 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  31.07 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  31.13 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  31.07 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  40.07 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  33.86 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  31.07 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  31.07 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  31.78 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  30.84 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  30.84 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4336  peptidase M24  35.13 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  31.36 
 
 		 444 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  30.34 
 
 		 441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  29.3 
 
 		 461 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  32.94 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  31.89 
 
 		 443 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  38.77 
 
 		 441 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  30.57 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  30.57 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  32.2 
 
 		 440 aa  162  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  30.37 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  30.82 
 
 		 437 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  32.73 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>