More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1161 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1161  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 
531 aa  1050    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398312  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27810  Xaa-Pro aminopeptidase  65.06 
 
 
522 aa  588  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.517657  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2481  peptidase M24  62.96 
 
 
517 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2910  peptidase M24  64.47 
 
 
513 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0334658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0769  peptidase M24  61.43 
 
 
521 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15300  Xaa-Pro aminopeptidase  59.35 
 
 
532 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0288526  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0703  peptidase M24  58.22 
 
 
517 aa  547  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11300  Xaa-Pro aminopeptidase  58.13 
 
 
515 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2508  Xaa-Pro aminopeptidase  56.63 
 
 
531 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000105082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2788  Xaa-Pro aminopeptidase  55.64 
 
 
530 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.364809  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19260  Xaa-Pro aminopeptidase  55.85 
 
 
494 aa  507  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00637043  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0216  aminopeptidase P  49.31 
 
 
531 aa  483  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0543  peptidase M24  52.55 
 
 
500 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0463  peptidase M24  51.22 
 
 
500 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0463  peptidase, M24 family  47.62 
 
 
531 aa  461  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3497  Xaa-Pro aminopeptidase  51.85 
 
 
539 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434008  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1246  Xaa-Pro aminopeptidase  50.5 
 
 
627 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623221  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5913  Xaa-Pro aminopeptidase  47.15 
 
 
479 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.117741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1744  xaa-Pro aminopeptidase  49.11 
 
 
510 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0389057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3026  hypothetical protein  47.5 
 
 
485 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371116  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3048  peptidase M24  47.03 
 
 
501 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.178755  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3284  Xaa-Pro aminopeptidase  49.36 
 
 
492 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.331819  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1364  Xaa-Pro aminopeptidase  50.42 
 
 
480 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3058  Xaa-Pro aminopeptidase  48.53 
 
 
492 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.11104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  47.88 
 
 
496 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0669  Xaa-Pro aminopeptidase  47.41 
 
 
506 aa  341  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.519514  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4713  Xaa-Pro aminopeptidase  42.68 
 
 
453 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  35.06 
 
 
439 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  35.67 
 
 
449 aa  213  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  34.37 
 
 
437 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  33.33 
 
 
461 aa  209  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  33.55 
 
 
441 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  33.91 
 
 
443 aa  208  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  33.69 
 
 
444 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  33.12 
 
 
444 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  33.69 
 
 
435 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  35.84 
 
 
437 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  30.35 
 
 
439 aa  203  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  33.26 
 
 
441 aa  203  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  34.26 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  34.05 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1524  aminopeptidase P  28.6 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0210879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  34.05 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  32.26 
 
 
443 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  34.61 
 
 
445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  32.98 
 
 
444 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  33.26 
 
 
443 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  32.47 
 
 
444 aa  200  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  33.19 
 
 
444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  34.14 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  32.98 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  33.83 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  36.64 
 
 
436 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  32.33 
 
 
446 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  32.33 
 
 
446 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2854  xaa-pro aminopeptidase  28.42 
 
 
414 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2539  xaa-pro aminopeptidase  28.42 
 
 
414 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  34.13 
 
 
439 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  34.13 
 
 
439 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  33.55 
 
 
444 aa  193  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  33.96 
 
 
454 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  36.96 
 
 
441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2008  Xaa-Pro aminopeptidase  30.74 
 
 
427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010826  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  31.98 
 
 
441 aa  190  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  34.13 
 
 
439 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  31.98 
 
 
441 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  32.26 
 
 
434 aa  190  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  31.98 
 
 
441 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  31.65 
 
 
436 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  31.98 
 
 
441 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  31.98 
 
 
441 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  31.98 
 
 
441 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  31.98 
 
 
441 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16211  putative aminopeptidase P  31.87 
 
 
441 aa  188  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.878711  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  35.42 
 
 
446 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  32.33 
 
 
441 aa  188  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  31.43 
 
 
436 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  35.19 
 
 
442 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  32.33 
 
 
441 aa  186  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  31.67 
 
 
441 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  29.98 
 
 
439 aa  186  9e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  31.89 
 
 
441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  34.86 
 
 
454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  32.16 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  34.25 
 
 
414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  33.7 
 
 
440 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  32.48 
 
 
437 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16321  putative aminopeptidase P  30.67 
 
 
441 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  32.21 
 
 
437 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  34.76 
 
 
442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  34.42 
 
 
514 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  32.61 
 
 
437 aa  184  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  31.85 
 
 
461 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2876  peptidase M24  29.78 
 
 
430 aa  183  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0874223  decreased coverage  0.00406602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  35.52 
 
 
447 aa  183  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1535  putative aminopeptidase P  29.91 
 
 
441 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.999654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  33.84 
 
 
462 aa  183  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  32.76 
 
 
461 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  32 
 
 
437 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  32 
 
 
437 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>