More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5262 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0195  peptidase M24  75 
 
 		 466 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4582  aminopeptidase P  77.78 
 
 		 463 aa  693    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0925  peptidase M24  77.54 
 
 		 460 aa  728    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3957  aminopeptidase P  80.13 
 
 		 721 aa  724    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3306  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain protein  80.13 
 
 		 463 aa  721    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  100 
 
 		 464 aa  951    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0086  peptidase M24  79.34 
 
 		 469 aa  742    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  68.48 
 
 		 462 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  68.25 
 
 		 473 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  60.26 
 
 		 462 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  60.95 
 
 		 458 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  60.56 
 
 		 459 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  60.17 
 
 		 465 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3394  xaa-pro aminopeptidase  61.77 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  57.08 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3399  aminopeptidase P  61.77 
 
 		 642 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612294  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  60.48 
 
 		 454 aa  508  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3358  xaa-pro aminopeptidase  61.34 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1135  Xaa-Pro aminopeptidase  61.56 
 
 		 481 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2360  Xaa-Pro aminopeptidase  61.56 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  59.78 
 
 		 474 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0274  Xaa-Pro aminopeptidase  61.56 
 
 		 481 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2540  Xaa-Pro aminopeptidase  61.56 
 
 		 481 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  57.45 
 
 		 499 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1254  Xaa-Pro aminopeptidase  61.64 
 
 		 611 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  58.1 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  58.66 
 
 		 468 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  57.54 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  57.45 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  56.47 
 
 		 461 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  57.14 
 
 		 514 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  57.54 
 
 		 461 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  57.33 
 
 		 461 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  57.33 
 
 		 461 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1577  peptidase M24  56.65 
 
 		 455 aa  480  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  56.6 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  51.52 
 
 		 440 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  49.46 
 
 		 433 aa  425  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  48.6 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  47.15 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  47.6 
 
 		 439 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  46.96 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  46.52 
 
 		 444 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  46.58 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  46.51 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  47.39 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  48.14 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  46.29 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  46.37 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  46.52 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  46.3 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  46.74 
 
 		 444 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  45.75 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  46.52 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  45.87 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  46.07 
 
 		 454 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  45.3 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  43.89 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  43.89 
 
 		 436 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  45.22 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  45.22 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  42.61 
 
 		 443 aa  354  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  40.17 
 
 		 439 aa  353  5e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  44.01 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  45.85 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  41.68 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  43.48 
 
 		 437 aa  349  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  42.58 
 
 		 441 aa  346  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  41.24 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  41.24 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  41.24 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  41.24 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  41.24 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  41.24 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  41.74 
 
 		 441 aa  343  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  41.03 
 
 		 441 aa  342  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  41.03 
 
 		 441 aa  342  7e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  43.23 
 
 		 449 aa  342  7e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  41.52 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  41.88 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  41.88 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  42.09 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  41.92 
 
 		 441 aa  340  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  41.21 
 
 		 435 aa  339  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  42.27 
 
 		 437 aa  338  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  41.67 
 
 		 438 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  41.67 
 
 		 438 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  42.46 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  42.06 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  42.06 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  44.11 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  45.43 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  41.24 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  39.91 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  42.24 
 
 		 439 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  45.2 
 
 		 446 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  42.21 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  41.7 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  39.82 
 
 		 439 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  44.78 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>