More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0400 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  90.04 
 
 		 458 aa  853    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  96.32 
 
 		 459 aa  904    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  77.66 
 
 		 474 aa  719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  100 
 
 		 462 aa  941    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  78.09 
 
 		 465 aa  714    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  63.22 
 
 		 464 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  63.41 
 
 		 499 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  63.22 
 
 		 464 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  62.78 
 
 		 461 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  62.67 
 
 		 514 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  62.56 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  64 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  62.56 
 
 		 461 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  62.33 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  62.33 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  58.54 
 
 		 458 aa  551  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1254  Xaa-Pro aminopeptidase  65.27 
 
 		 611 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3394  xaa-pro aminopeptidase  64.82 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3399  aminopeptidase P  64.82 
 
 		 642 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  61.12 
 
 		 473 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2360  Xaa-Pro aminopeptidase  64.38 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0274  Xaa-Pro aminopeptidase  64.38 
 
 		 481 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3358  xaa-pro aminopeptidase  64.6 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2540  Xaa-Pro aminopeptidase  64.38 
 
 		 481 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1135  Xaa-Pro aminopeptidase  64.38 
 
 		 481 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  59.05 
 
 		 462 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1577  peptidase M24  58.5 
 
 		 455 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  60.26 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  59.39 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  57.67 
 
 		 440 aa  510  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  60.14 
 
 		 447 aa  500  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0086  peptidase M24  57.53 
 
 		 469 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0925  peptidase M24  59.01 
 
 		 460 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4582  aminopeptidase P  61.74 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3306  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain protein  61.29 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3957  aminopeptidase P  61.29 
 
 		 721 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0195  peptidase M24  60 
 
 		 466 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  53.12 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  52.21 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  50.34 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  52.42 
 
 		 454 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  53.04 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  49 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  49.33 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  49.89 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  48.57 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  48.66 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  49.78 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  48.66 
 
 		 444 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  50.82 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  48.89 
 
 		 454 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  47.77 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  47.11 
 
 		 439 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  50.58 
 
 		 444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  45.68 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  47.54 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  50.58 
 
 		 444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  50.35 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  45.45 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  48.31 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  48.31 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  50.22 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  44.32 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  44.1 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  43.88 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  43.88 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  43.88 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  43.88 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  43.88 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  43.88 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  43.88 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  46.1 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  45.21 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  45.33 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  47.09 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  43.27 
 
 		 443 aa  372  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  44.1 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  42.44 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  43.65 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  43.88 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  43.65 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  43.65 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  43.65 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  42.6 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  43.86 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  45.66 
 
 		 437 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  43.64 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  45.43 
 
 		 437 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  45.43 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  44.32 
 
 		 441 aa  362  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  44.32 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  44.86 
 
 		 441 aa  356  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  47.32 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  47.54 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  47.01 
 
 		 446 aa  351  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  42.61 
 
 		 449 aa  349  5e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  46.85 
 
 		 442 aa  348  9e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  44.34 
 
 		 414 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  45.58 
 
 		 445 aa  347  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  44.22 
 
 		 435 aa  345  7e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.390253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>