More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1440 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  100 
 
 		 461 aa  956    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  58.13 
 
 		 465 aa  569  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0811  Xaa-Pro dipeptidase  44.69 
 
 		 471 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5472  Xaa-Pro dipeptidase  43.33 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  39.47 
 
 		 464 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  35.62 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  35.62 
 
 		 451 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  33.91 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0766  peptidase M24  33.62 
 
 		 459 aa  269  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.498025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  33.04 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  32.6 
 
 		 455 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1467  Xaa-Pro dipeptidase  32.45 
 
 		 493 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  30.72 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  30.59 
 
 		 437 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  30.33 
 
 		 441 aa  183  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  29 
 
 		 441 aa  183  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  29.64 
 
 		 441 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  29.92 
 
 		 441 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  30.33 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  30.33 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  30.33 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  30.33 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  29.92 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  30.33 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  28.99 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  30.13 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  30.04 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  30.04 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  30.04 
 
 		 438 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  30.04 
 
 		 438 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  28.78 
 
 		 437 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  28.78 
 
 		 437 aa  179  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  30.04 
 
 		 438 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  29.55 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  28.45 
 
 		 443 aa  176  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  29.27 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  29.51 
 
 		 439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  28 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  29.34 
 
 		 435 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  29.55 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  28.72 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  29.35 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  28.54 
 
 		 446 aa  171  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  28.54 
 
 		 446 aa  171  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  28.48 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.735607 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  28.57 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  29.35 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  29.96 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  28.99 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  28.88 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  27.37 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  27.39 
 
 		 444 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  27.59 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  28.72 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  29.76 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  29.44 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  27.84 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0500  putative aminopeptidase P  30.36 
 
 		 441 aa  163  7e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0229386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  27.64 
 
 		 444 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  29.26 
 
 		 440 aa  162  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  29.09 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  26.96 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  28.51 
 
 		 437 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  28.69 
 
 		 449 aa  161  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  28.09 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  28.3 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  28.39 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  26.58 
 
 		 461 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  28.16 
 
 		 441 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  29.24 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  28.74 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  28.18 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1744  xaa-Pro aminopeptidase  28.99 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0389057  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0075  aminopeptidase P  29.51 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.819876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  27.39 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  27.22 
 
 		 437 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  28.33 
 
 		 444 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04951  putative aminopeptidase P  29.66 
 
 		 425 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  28.72 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  28.94 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  28.31 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  28.3 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  28.3 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  28.57 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15611  putative aminopeptidase P  27.71 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  27.2 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  28.32 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  26.87 
 
 		 442 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  30.67 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  27.85 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2176  aminopeptidase P  28.92 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  27.64 
 
 		 443 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  28.09 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  28.01 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  26.89 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  26.25 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  26.87 
 
 		 442 aa  147  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  28.79 
 
 		 446 aa  146  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  27.37 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  26.48 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>