More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0014 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0021  proline dipeptidase  97.95 
 
 
440 aa  900    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0017  proline dipeptidase  98.18 
 
 
440 aa  902    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0022  proline dipeptidase  93.62 
 
 
439 aa  864    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0021  proline dipeptidase  97.73 
 
 
440 aa  900    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0020  proline dipeptidase  78.08 
 
 
440 aa  726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930691  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0022  proline dipeptidase  79 
 
 
439 aa  749    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324765  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0024  proline dipeptidase  81.05 
 
 
439 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.0225878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0019  proline dipeptidase  74.2 
 
 
440 aa  697    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0016  proline dipeptidase  79.55 
 
 
440 aa  757    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.98827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0014  proline dipeptidase  100 
 
 
440 aa  917    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.258964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0019  proline dipeptidase  94.53 
 
 
439 aa  869    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0806227  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0017  proline dipeptidase  94.99 
 
 
439 aa  874    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.767781  normal  0.0779588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0014  proline dipeptidase  77.73 
 
 
439 aa  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0022  proline dipeptidase  97.5 
 
 
440 aa  897    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0718408  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0025  proline dipeptidase  95.22 
 
 
439 aa  875    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000000409434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0033  proline dipeptidase  75.8 
 
 
439 aa  710    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.12189  normal  0.0842725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0013  proline dipeptidase  56.98 
 
 
443 aa  547  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0199  proline dipeptidase  58.82 
 
 
443 aa  528  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03734  proline dipeptidase  57.01 
 
 
448 aa  524  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3932  proline dipeptidase  51.24 
 
 
443 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0284  proline dipeptidase  51.24 
 
 
443 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3900  proline dipeptidase  53.72 
 
 
443 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.022198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3746  proline dipeptidase  53.05 
 
 
443 aa  477  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0139114  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1913  proline dipeptidase  51.02 
 
 
443 aa  477  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137948  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0263  proline dipeptidase  51.24 
 
 
443 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00615185  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4233  proline dipeptidase  51.69 
 
 
443 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4043  proline dipeptidase  51.69 
 
 
443 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3948  proline dipeptidase  50.56 
 
 
443 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  0.023319 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4228  proline dipeptidase  50.34 
 
 
443 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000144079  normal  0.0133545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03738  proline dipeptidase  50.34 
 
 
443 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4134  peptidase M24  50.34 
 
 
443 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.689702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03687  hypothetical protein  50.34 
 
 
443 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4163  proline dipeptidase  50.34 
 
 
443 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215567  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4070  proline dipeptidase  50.34 
 
 
443 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4366  proline dipeptidase  50.34 
 
 
443 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000311805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4317  proline dipeptidase  50.11 
 
 
443 aa  458  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00026447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5286  proline dipeptidase  50.11 
 
 
443 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0321906  normal  0.0291317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4263  proline dipeptidase  48.99 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4191  proline dipeptidase  48.99 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4310  proline dipeptidase  48.99 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.554834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4370  proline dipeptidase  48.99 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4214  proline dipeptidase  48.99 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0112386  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02375  proline dipeptidase  47.8 
 
 
492 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3276  proline dipeptidase  46.74 
 
 
443 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0455  proline dipeptidase  40.89 
 
 
429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3908  proline dipeptidase  37.62 
 
 
433 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5810  peptidase M24  37.28 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.924426 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  29.78 
 
 
465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  30.18 
 
 
443 aa  149  9e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  28.67 
 
 
429 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  27.97 
 
 
454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  31.93 
 
 
475 aa  134  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  26.59 
 
 
439 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  27.98 
 
 
469 aa  133  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  27.16 
 
 
490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_29983  predicted protein  31.33 
 
 
524 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  33.44 
 
 
464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  27.79 
 
 
437 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  28.17 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  27.79 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  27.57 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  28.92 
 
 
442 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  29.14 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  31.6 
 
 
452 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  26.52 
 
 
437 aa  126  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  31.4 
 
 
463 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  27.31 
 
 
473 aa  126  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  28.31 
 
 
439 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  34.34 
 
 
436 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  26.49 
 
 
462 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  30.51 
 
 
459 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  30.38 
 
 
458 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  28.44 
 
 
433 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  28.38 
 
 
454 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  27.63 
 
 
436 aa  123  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  30.61 
 
 
451 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0500  putative aminopeptidase P  34.39 
 
 
441 aa  123  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0229386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  30.72 
 
 
437 aa  123  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  31.03 
 
 
441 aa  123  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  31.03 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  29.85 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  29.74 
 
 
499 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  29.28 
 
 
514 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  28.07 
 
 
439 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  33.68 
 
 
461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  30.27 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  30.75 
 
 
436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  27.72 
 
 
436 aa  120  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  28.02 
 
 
461 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  26.33 
 
 
465 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  29.89 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.429272 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  31.12 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  31.01 
 
 
441 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02200  prolidase, putative  26.07 
 
 
546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.555786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  29.33 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  31.12 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4336  peptidase M24  31.71 
 
 
389 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  27.1 
 
 
464 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  31.12 
 
 
441 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  34.59 
 
 
468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>